Phân lập, tuyển chọn và đánh giá các đặc tính probiotic của một số chủng vi sinh vật hữu ích để sản xuất các chế phẩm probiotic dùng trong chăn nuôi

TRẦN QUỐC VIỆT - Phân lập , tuyển chọn và đánh giá …. 1 PHÂN LẬP, TUYỂN CHỌN VÀ ĐÁNH GIÁ CÁC ĐẶC TÍNH PROBIOTIC CỦA MỘT SỐ CHỦNG VI SINH VẬT HỮU ÍCH ĐỂ SẢN XUẤT CÁC CHẾ PHẨM PROBIOTIC DÙNG TRONG CHĂN NUÔI Trần Quốc Việt1, Bùi Thị Thu Huyền1, Dương Văn Hợp2 và Vũ Thµnh L©m2 1Viện Chăn nuôi - Thụy Phượng - Từ Liêm - Hà Nội 2 Viện Vi sinh vật và Công nghệ sinh học - Đại học Quốc gia - Hà Nội. *Tác giả liên hệ: Trần Quốc Việt - Bộ môn Dinh Dưỡng, Thức ăn và Đồng cỏ Viện Chăn nuôi - Thụy Phương - Từ Liêm - Hà Nội Tel: (04) 38.386.126 / 0982.011.584; Fax: (04) 38.389.775; Email: hainiah2008@gmail.com ABSTRACT Isolation, selection and evaluation of probiotic characteristics of some kinds of useful microorganism for probiotic producton Sixty four strains of microorganism were isolated from the intestinal content of pigs, chickens and from commercial probiotics. Amongs them, 4 strains including two strains of lactic bacteria and two strains of yeast were selected for futher investigation of their characteristics. Based on metabolic characteristics and taxonomic key of Bergey and frequency of rADR 16S analysis, two strains of lactic bacteria were belong to Lactbacillus fermentum named NC1 and Lactobacillus casei named NC2 and two strains of yeast were classed as Saccharomyces cerevisiae-SC and Saccharomyces boulardii-SB. All of strains selected were useful microorganisms with a high toleran to low and high pH environments and to a high level of bile salt. These strains were also highly compatible with some active components commonly used in diets for pigs and chickens such as some kinds of antibiotics (BMD, colistin, chlotetracylin ..), acidifiers, CuSO4, ZnSO4..etc. It was concluded that these strains could be considered as useful microorganisms for the probiotic production. Key words: Microorganism, probiotics, lactic bacteria, yeast, compatibility. ĐẶT VẤN ĐỀ Từ thời cổ đại con người đã biết sử dụng các Vi sinh vật (VSV) để chế biến và bảo quản thực phẩm, nhưng ý tưởng tạo ra những sản phẩm VSV sống hữu ích để bổ sung vào thức ăn hoặc nước uống nhằm cải thiện sức khoẻ và nâng cao năng suất của vật nuôi chỉ được quan tâm nhiều trong vài thập kỷ trở lại đây. Năm 1974 Paker đã đưa ra khái niệm probiotic để chỉ những VSV và những chất làm cân bằng hệ VSV trong đường ruột của người và vật nuôi, kể từ đó đã có rất nhiều những phát hiện mới về vai trò, tác dụng của các VSV sống như: tăng cường sức khoẻ của hệ tiêu hoá thông qua cải thiện cân bằng hệ vi sinh vật ruột (Fuller, 1989), tăng đáp ứng miễn dịch, phòng chống ung thư đường tiêu hoá (FAO/WHO, 2001), giảm colesterol máu (Pereira và Gibson, 2002)... Các (VSV) probiotic nhất thiết phải là các VSV sống hữu ích, chúng có thể là các vi khuẩn (VK) (thường là các VK khuẩn lactic, một số chủng Bacillus) và nấm men (chủ yếu là các chủng thuộc loài Saccharomyces cerevisiae và Saccharomyces bouladii). Trong tự nhiên, các VSV hữu ích rất phong phú, đa dạng nhưng chúng chỉ có thể là các VSV probiotic khi chúng thoả mãn được một số điều kiện: (i) có sức sống cao; (ii) tồn tại được trong môi trường đường tiêu hoá (pH thấp, muối mật, có khả năng bám dính vào niêm mạc đường tiêu hoá), (iii) phát triển và cạnh tranh được với các vi sinh vật có hại trong đường ruột, (iv) có khả năng sản sinh các bacteriocin và hoặc enzyme tiêu hóa; (v) có khả năng làm tăng đáp ứng miễn dịch. Vì những đặc điểm này mà việc phân lập, tuyển chọn các vi sinh vật probiotic trở nên rất khó khăn, phức tạp. Hầu như rất hiếm có những chủng VSV hội đủ các điều kiện trên. Bởi vậy, để VIỆN CHĂN NUÔI - Tạp chí Khoa học Công nghệ Chăn nuôi - Số 16-Tháng 2-2009 2 có chất lượng cao, sản phẩm probiotic thường gồm nhiều loại VSV thuộc các loài khác nhau (Multispecies Probiotic) (Timmerman và cs, 2006). Nghiên cứu này được tiến hành nhằm phân lập, đánh giá, tuyển chọn các chủng vi sinh vật có các đặc tính probiotic phục vụ cho việc sản xuất các chế phẩm Probiotic dùng trong chăn nuôi. VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU Vật liệu nghiên cứu Các vật liệu phục vụ cho việc phân lập tuyển chọn các vi sinh vật probiotic: Phân, chất chứa đường tiêu hoá (ruột non, manh tràng) của lợn và gia cầm (gà, ngan, vịt). Một số sản phẩm probiotic thương mại (Lacto-Sac của hãng Alltech-Canada; EM của Nhật; E-Lac của Hàn quốc…vv). Các vi sinh vật kiểm định (Salmonella enteritidis, E. coli và Shigella flexneri); các vi sinh vật probiotic đã được phân lập, tuyển chọn và đánh giá đặc tính probiotic1 được bảo quản tại bảo tàng giống chuẩn vi sinh vật thuộc Viện Vi Sinh Vật và Công nghệ sinh học-Đại học Quốc gia Hà nội. Các hóa chất: dùng để tách ADN và phân giải trình tự: EDTA, Tris- SDS, chlorofom-isoamyl alcohol, dNTP, Taq polymeraza, Ethidium Bromit, kit QIAgen...vv. Các vật liệu khác: Giá đỗ, đường gluco, K2HPO4, MgSO4, natri glutamat, pepton, cao nấm men; dextrin, tinh bột sắn, bột sữa whey. Phương pháp nghiên cứu Phân lập, tuyển chọn các chủng vi sinh vật hữu ích Mẫu được pha loãng ở nồng độ từ 10-3-10-5 và cấy gạt trên môi trường MRS (đối với vi khuẩn Lactic) và YM (đối với nấm men). Sau khi cấy các mẫu được giữ trong tủ ấm ở nhiệt độ 37oC cho vi khuẩn (VK) và 30oC cho nấm men trong 48 giờ. Sau 48 giờ trên môi trường MRS chọn các khuẩn lạc tạo vòng phân giải CaCO3; trên môi trường (Yeast Malt- YM) chọn các khuẩn lạc nấm men tròn đều, trơn nhẵn soi kính có hình trứng và nảy chồi. Đánh giá đặc điểm hình thái, phân loại và định danh các chủng VSV hữu ích Hình thái tế bào được quan sát sau khi nuôi cấy từ 24 đến 48 giờ trên các môi trường MRS (với VK Lactic) và YM (với nấm men). Hoạt tính catalaza và sinh khí CO2 từ các nguồn đường khác nhau có nồng độ 1% (raffinoza = 2%) được xác định bằng phương pháp của Kozaki và cs, (1992). Ngoài ra, các chủng nấm men còn được thử phản ứng DBB và hoạt tính Ureaza. Việc phân loại các chủng vi khuẩn được thực hiện dựa trên cơ sở khoá phân loại của Bergeys (Holt và cs, 2000) (theo các chỉ tiêu chủ yếu như: hình thái tế bào, khuẩn lạc, nhuộm Gram, phản ứng catalaza và lên men một số loại đường) và phân tích, giải trình tự 16S rARN theo phương pháp được giới thiệu bởi Lane (1991). Xác định trình tự rADN 16s của các chủng vi khuẩn lactic theo phương pháp của Saito và Miura (1963) và trình tự rADN ITS1, ITS4 của các chủng nấm men theo phương pháp của Manitis và cs (1982). Đánh giá một số đặc tính probiotic của các chủng VSV hữu ích Đánh giá khả năng chịu nhiệt: Các chủng vi sinh vật được nuôi cấy trên môi trường MRS TRẦN QUỐC VIỆT - Phân lập , tuyển chọn và đánh giá …. 3 dịch thể (VK Lactic) và môi trường YM (nấm men) (pH =7.0), trong các máy lắc ổn nhiệt (200 vòng/phút) với các giải nhiệt độ khác nhau 30; 37; 45; 55oC. Đánh giá khả năng sinh trưởng trong môi trường có độ pH khác nhau Tương tự như trên, các chủng vi khuẩn và nấm men cũng được nuôi cấy trên môi trường dịch thể trong đệm acetat có pH khác nhau (2,2; 3,0; 4,0; 5,0; 6,0; 7,0), trên máy lắc ổn nhiệt (200 vòng/ phút tại 37oC cho vi khuẩn Lactic và 30oC cho nấm men). Đánh giá khả năng sinh trưởng trong môi trường có nồng độ muối mật khác nhau Các chủng nghiên cứu cũng được nuôi cấy trên môi trường dịch thể như trên có nồng độ muối mật (0,2; 0,5; 1;1,5; 2; 3%). Nuôi cấy lắc (200 vòng/phút tại 37oC đối với vi khuẩn và 30oC đối với nấm men). Đếm mật độ tế bào sau 48h nuôi cấy gạt trên đĩa Petri có chứa môi trường thích hợp. Sau 48 giờ, tốc độ sinh trưởng của các chủng vi khuẩn được đánh giá thông qua số lượng VSV tính bằng cfu/ml và khả năng sản sinh axit lactic. Khả năng sản sinh axit lactic của các VK Lactic được đánh giá theo phương pháp Therner và cs (1894). Khả năng kháng các vi khuẩn kiểm định (Salmonella enteritidis, E. coli, Shigella flexneri): được tiến hành theo phương pháp đo vòng kháng khuẩn.Tính đối kháng của các vi sinh vật: Được thử bằng kỹ thuật cấy vạch trên đĩa thạch. Đánh giá khả năng bám dính vào niêm mạc đường tiêu hóa Chuẩn bị vi sinh vật và vật liệu bám dính: Vi sinh vật (vi khuẩn và nấm men) được nuôi cấy thuần khiết trong môi trường thích hợp cho từng chủng. Chuẩn bị các mẫu ruột gà tươi: Rửa các đoạn ruột non (từ gà broiler mạnh khỏe) 3 lần với đệm PBS sao cho tất cả các vi sinh vật không còn trên bề mặt niêm mạc ruột. Rửa 1 lần với môi trường (MRS cho vi khuẩn và YM cho nấm men). Tiến hành thử bám dính: Phủ dịch tế bào đã chuẩn bị ở trên lên trên bề mặt niêm mạc ruột. Ủ 90 phút trong tủ ấm (37oC). Rửa mẫu ruột lần 1 bằng nước muối sinh lý1%. Rửa mẫu ruột 3 lần bằng đệm PBS. Thu lấy dịch rửa của cả 3 lần và trộn đều. Đếm số lượng VSV trong dịch rửa để xác định khả năng bám dính của các VSV nghiên cứu. Đánh giá tính tương thích của các chủng vi sinh vật với các thành phần có hoạt tính trong khẩu phần ăn cho lợn và gia cầm: Các chủng nghiên cứu được nuôi cấy trên môi trường dịch thể tương ứng (MRS cho VK Lactic; thạch thường cho VK Bacillus và YM cho nấm men) nhưng có bổ sung các thành phần có hoạt tính thường có trong các khẩu phần ăn cho lợn và gia cầm gồm một số loại kháng sinh: Bacitracin Methylene Disalicylate (BMD) (50 ppm); Saigon Nox (100 ppm), Colistine 98% (100 ppm), chlotetracyclin (CTC) 15% (100 ppm); một số loại khoáng CuSO4 (250 ppm Cu); ZnSO4 (100 ppm Zn) và hỗn hợp axit hữu cơ (gồm axit lactic axit, axit formic, axit citric...) với liều 200mg/lít.. Nuôi cấy lắc (200 vòng/phút) trong tủ ấm (37oC). Đếm mật độ tế bào trên môi trường đĩa thạch sau 48h. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN Phân lập, tuyển chọn, phân loại và định danh các chủng vi sinh vật hữu ích Từ các nguồn khác nhau (chất chứa đường ruột của lợn, gà và các mẫu sản phẩm probiotic thương mại), 64 chủng vi sinh vật đã được phân lập, trong đó có 27 chủng vi khuẩn lactic (42,2%) và 39 chủng nấm men (57,8%) (Bảng 1). Trong đó từ chất chứa đường ruột của lợn và gia cầm đã phân lập được 25 chủng vi khuẩn lactic, 32 chủng nấm men. Từ một số chế phẩm probiotic hiện đang lưu hành trên thị trường, đã phân lập được 2 chủng vi khuẩn lactic và 7 chủng nấm men. VIỆN CHĂN NUÔI - Tạp chí Khoa học Công nghệ Chăn nuôi - Số 16-Tháng 2-2009 4 Bảng 1: Kết quả phân lập các vi sinh vật từ các nguồn khác nhau Vi sinh vật Nguồn phân lập VK Lactic Nấm men Chất chứa ruột non và ruột già của lợn. 10 4 Chất chứa ruột non, ruột già của gà 15 28 Bốn (4) mẫu sản phẩm probiotic thương mại 2 7 Cổng 27 39 Tổng số 64 Kết quả phân lập các mẫu sản phẩm probiotic thương mại cho thấy, tất cả các sản phẩm này đều là các sản phẩm probiotic đa chủng. Để làm cơ sở cho việc tuyển chọn, các chủng VSV trên tiếp tục được thuần khiết trên môi trường đĩa thạch và chọn được 4 chủng (2 chủng VK lactic và 2 chủng nấm men) để đánh giá các đặc tính hình thái, sinh lý, sinh hóa quan trọng làm cơ sở cho việc phân loại. Kết quả được trình bày ở Bảng 2 và 3. Bảng 2: Đặc điểm hình thái, sinh lý, sinh hoá của 2 chủng vi khuẩn lactic Kí hiệu chủng TT Đặc điểm NC1 NC2 1 Hình dạng tế bào Que ngắn Que ngắn 2 Nhuộm Gram Gram + Gram + 3 Phản ứng catalaza - - Khả năng đồng hoá nguồn cacbohydrat 4 Riboza - + 5 Xyloza - + 6 Arabinoza + + 7 Rhamnoza + + 8 Trehaloza + ++ 9 Lactoza +++ ++ 10 Mannitol ++ ++ 11 Sucroza +++ +++ 12 Cellobioza +++ +++ 13 Raffinoza ++ ++ 14 Galactoza + ++ 15 Tinh bột + - 16 Gluconat ++ +++ 17 Fructoza + ++ 18 Thành tế bào có meso-DAP + + Hai chủng vi khuẩn Lactic được lựa chọn (NC1 và NC2) đều là những VK hình que ngắn, Gram dương và phảm ứng katalaza âm tính. Đây là những đặc điểm đặc trưng của các VK Lactic. Tuy nhiên, khả năng đồng hoá các nguồn carbohydrate của 2 chủng này có những khác biệt, Chủng NC2 có khả năng đồng hóa hầu hết các nguồn carbohydrate nghiên cứu trừ tinh bột, trong đó chủng NC1 có khả năng đồng hóa tinh bột ở mức thấp, nhưng lại không có khả năng đồng hóa riboza và xyloza. Cả 2 chủng đều có khả năng đồng hoá tốt 2 nguồn carbohydrate cơ bản là Sucroza và Cellobioza, hai chủng nấm men đều có hình trứng, elip, nhưng SC nảy chồi TRẦN QUỐC VIỆT - Phân lập , tuyển chọn và đánh giá …. 5 1,2,3 phía, trong khi đó SB chỉ nảy chồi 1 phía. Cả 2 chủng đều có hình thái khuẩn lạc như nhau (trắng sữa, tròn nhẵn bóng và có vòng đồng tâm) kết quả ở Bảng 3. Nhìn chung, đặc điểm đồng hóa và lên men các nguồn carbohydrate của 2 chủng nấm men tương tự nhau, cả hai đều có phản ứng âm tính với DBB và thuỷ phân urê. Căn cứ vào khoá phân loại của Bergeys và các dữ liệu ở các bảng 2 và 3 thì chủng NC1 thuộc nhóm Lactobacillus fermentum, chủng NC2 thuộc nhóm Lactobacillus casei, chủng SC thuộc Saccharomyces cerevisiae và chủng SB thuộc nhóm Saccharomyces nhưng chưa rõ loài. Bảng 3: Một số đặc tính hình thái và sinh lý sinh hoá của hai chủng nấm men SC và SB STT Đặc điểm Chủng nấm men SC SB 1 Hình dạng tế bào Hình trứng, elíp, nảy chồi 1,2,3 phía Hình trứng, elíp, nảy chồi 1 phía Trắng sữa tròn nhẵn bóng lồi có vòng đồng tâm Trắng sữa tròn nhẵn bóng lồi có vòng đồng tâm 2 Hình thái khuẩn lạc Kh/năng đồng hoá nguồn cacbohydrat KN lên men nguồn cacbohydrat KN đồng hoá nguồn Cacbohydrat KN lên men nguồn cacbohydrat 3 Sorboza - - - - 4 Riboza - - 5 Xyloza - - - - 6 Arabinoza - - - - 7 Rhamnoza - - - - 8 Trehaloza + + + + 9 Lactoza - - - - 10 Sucroza + + + + 11 Cellobioza - - - - 12 Raffinoza + + + + 13 Galactoza + + + + 14 Tinh bột - - - - 15 Melibioza - - _ _ 16 Glucoza + + + + 17 Sinh axit - - 18 Phản ứng DBB - - 19 Phản ứng thuỷ phân urê - - Tuy nhiên, để gọi tên chính xác, các chủng trên đã được giải trình tự ARN và ADN 16S. Các kết quả định danh được trình bày như sau: Trình tự rADN 16S của chủng NC1 >NC1 GCCAACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAACACGTAGGTAACCTGCCCAGAAGCGGGGGACAACATTT GGAAACAGATGCTAATACCGCATAACAGCGTTGTTCGCATGAACAACGCTTAAAAGATGGCTTCTC GCTATCACTTCTGGATGGACCTGCGGTGCATTAGCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGA TGATGCATAGCCGAGTTGAGAGACTGATCGGCCACAATGGGACTGAGACACGGCCCATACTCCTAC GGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGGCGCAAGCCTGATGGAGCAACACCGCGTGAGTG AAGAAGGGTTTCGGCTCGTAAAGCTCTGTTGTTAAAGAAGAACACGTATGAGAGTAACTGTTCATA CGTTGACGGTATTTAACCAGAAAGTCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGT VIỆN CHĂN NUÔI - Tạp chí Khoa học Công nghệ Chăn nuôi - Số 16-Tháng 2-2009 6 GGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTAAAGAGAGTGCAGGCGGTTTTCTAAGTCTGATGTGAA GCCTTCGGCTTAACCGGAGAAGTGCATCGGAAACTGGATAACTTGAGTGCAGAAGAGGGTAGTGG AACTCCATGTGTAGCGGTGGAATGCGTAAATATATGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGGCTACC TGGTCTGCAACTGACGCTGAGACTCGAAAGCATGGGTAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTC CATGCCGTAAACGATGAGTGCTAGGTGTTGGAGGGTTTCCGCCCTTCAGTGCCGGAGCTAACGCAT TAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCGAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCA CAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCTACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCTTG CGCCAACCCTAGAGATAGGGCGTTTCCTTCGGGAACGCAATGACAGGTGGTGCATGGTCGTCGTCA GCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGTTACTAGTTGCCAGCA TTAAGTTGGGCACTCTAGTGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAGAT CATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGACGGTACAACGAGTCGCGAACTC GCGAGGGCAAGCAAATCTCTTAAAACCGTTCTCAGTTCGGACTGCAGGCTGCAACTCGCCTGCACG AAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACAC ACCGCCCGTCCCACCATGAGAGTTTGTAACACCCAAAGTCGGTGGGGTAACCTTTTAGGAGCCAGC CGCTAAGGTGGGACAGATGATTAGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTAGGAGAACCTGCGGCT GGATCACCTCCTTT Trình tự rADN 16S của chủng NC1 tương đồng với trình tự rADN 16S của Lactobacillus fermentum 99,7 % (1446/1450). Trình tự rADN 16S của chủng NC2 >NC2 ACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGGCGAACGAGTTCTCGTTGATGATCGGTGCTTGCACCG AGATTCAACATGGAACGAGTGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCCTTAAGTGGGG GATAACATTTGGAAACAGATGCTAATACCGCATAGATCCAAGAACCGCATGGTTCTTGGCTGAAAG ATGGCGTAAGCTATCGCTTTTGGATGGACCCGCGGCGTATTAGCTAGTTGGTGAGGTAATGGCTCA CCAAGGCGATGATACGTAGCCGAACTGAGAGGTTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCC AAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGCAAGTCTGATGGAGCAACGC CGCGTGAGTGAAGAAGGCTGTCGGGTCGTAAAACTCTGTTGTTGGAGAAGAATGGTCGGCAGAGT AACTGTTGTCGGCGTGACGGTATCCAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGT AATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGGCGGTTTTTTAAG TCTGATGTGAAAGCCCTCGGCTTAACCGAGGAAGCGCATCGGAAACTGGGAAACTTGAGTGCAGA AGAGGACAGTGGAACTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGGAAGAACACCAGTGGCG AAGGCGGCTGTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGCTCGAAAGCATGGGTAGCGAACAGGATTAGA TACCCTGGTAGTCCATGCCGTAAACGATGAATGCTAGGTGTTGGAGGGTTTCCGCCCTTCAGTGCC GCAGCTAACGCATTAAGCATTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTG ACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAG GTCTTGACATCTTTTGATCACCTGAGAGATCAGGTTTCCCCTTCGGGGGCAAAATGACAGGTGGTG CATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATG ACTAGTTGCCAGCATTTAGTTGGGCACTCTAGTAAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGG GATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGATGGTACAAC GAGTTGCGAGACCGCGAGGTCAAGCTAATCTCTTAAAGCCATTCTCAGTTCGGACTGTAGGCTGCA ACTCGCCTACACGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCACGCCGCGGTGAATACGTTCCC GGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGAGAGTTTGTAACACCCGAAGTCGGTGGCGTAACCC TTTTAGGGAGCGAGCCGTCTAAGGTGGGACAAATGATTAGGGG Trình tự rADN 16S của chủng NC2 tương đồng với trình tự rADN 16S của Lactobacillus casei 99,7 % ( 1483/1486 ). Trình tự ADN 26S của chủng SC. >SC-I1 TTAAAGAAATTTAATAATTTTGAAAATGGATTTTTTTGTTTTGGCAAGAGCATGAGAGCTTTTACTG GGCAAGAAGACAAGAGATGGAGAGTCCAGCCGGGCCTGCGCTTAAGTGCGCGGTCTTGCTAGGCT TGTAAGTTTCTTTCTTGCTATTCCAAACGGTGAGAGATTTCTGTGCTTTTGTTATAGGACAATTAAA ACCGTTTCAATACAACACACTGTGGAGTTTTCATATCTTTGCAACTTTTTCTTTGGGCATTCGAGCA ATCGGGGCCCAGAGGTAACAAACACAAACAATTTTATTTATTCATTAAATTTTTGTCAAAAACAAG AATTTTCGTAACTGGAAATTTTAAAATATTAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATC GATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTT TGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCAGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAA CATTCTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTTTGGAGTTAACTTGAAATTGCTGGCCTTTTCATTGGATGT TTTTTTTCCAAAGAGAGGTTTCTCTGCGTGCTTGAGGTATAATGCAAGTACGGTCGTTTTAGGTTTT ACCAACTGCGGCTAATCTTTTTTATACTGAGCGTATTGGAACGTTATCGATAAGAAGAGAGCGTCT TRẦN QUỐC VIỆT - Phân lập , tuyển chọn và đánh giá …. 7 AGGCGAACAATGTTCTTAAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGAGTACCCGCTGACTTAGCATATCA ATAGCGAAGAAAGAAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACCGGGATTGCCTTAGTAA CGGCGAGTGAAGCGGCAAAAGCTCAAATTTGAAATCTGGTACCTTCGGTGCCCGAGTTGTAATTTG GAGAGGGCAACTTTGGGGCCGTTCCTTGTCTATGTTCCTTGGAACAGGACGTCATAGAGGGTGAGA ATCCCGTGTGGCGAGGAGTGCGGTTCTTTGTAAAGTGCCTTCGAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATG CAGCTCTAAGTGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCG AGAGACCGATAGCGAACAAGTACAGTGATGGAAAGATGAAAAGAACTTTGAAAAGAGAGTGAAA AAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGGGCATTTGATCAGACATGGTGTTTTGTGCCCTCTGCTCC TTGTGGGTAGGGGAATCTCGCATTTCACTGGGCCAGCATCAGTTTTGGTGGCAGGATAAATCCATA GGAATGTAGCTTGCCTCGGTAAGTATTATAGCCTGTGGGAATACTGCCAGCTGGGACTGAGGACTG CGACGTAAGTCAAGGATGCTGGCATAATGGTTATATGCCGCCGTCTTGAAACAGGACC Trình tự gen của chủng SC tương đồng 100% với Saccharomyces cerevisiae >SB-I1 GCCGGGCCTGCGCTTAAGTGCGCGGTCTTGCTAGGCTTGTAAGTTTCTTTCTTGCTATTCCAAACGG TGAGAGATTTCTGTGCTTTTGTTATAGGACAATTAAAACCGTTTCAATACAACACACTGTGGAGTTT TCATATCTTTGCAACTTTTTCTTTGGGCATTCGAGCAATCGGGGCCCAGAGGTAACAAACACAAAC AATTTTATCTATTCATTAAATTTTTGTCAAAAACAAGAATTTTCGTAACTGGAAATTTTAAAATATT AAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGT AATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCTTGGTATTCCA GGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACATTCTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTTT GGAGTTAACTTGAAATTGCTGGCCTTTTCATTGGATGTTTTTTTTCCAAAGAGAGGTTTCTCTGCGT GCTTGAGGTATAATGCAAGTACGGTCGTTTTAGGTTTTACCAACTGCGGCTAATCTTTTTTTATACT GAGCGTATTGGAACGTTATCGATAAGAAGAGAGCGTCTAGGCGAACAATGTTCTTAAAGTTTACCT CTCAAATCAGGTAGGAGTACCCGCTGAACTTAAGCATAC Trình tự gen của SB tương đồng 100% với Saccharomyces boulardii, sai khác 12 /707 bp với Saccharomyces cerevisiae. Các kết quả phân loại theo phương pháp cổ điển và dựa vào phân tích trình tự ADN và ARN được trình bày ở Bảng 4. Bảng 4: Kết quả phân loại và định danh các chủng được lựa chọn STT Kí hiệu Dựa vào phân tích trình tự 16S rARN Theo phương pháp cổ điển 1