Đầu tiên được mô tả bởi Thom vào năm 1906, Penicillium roqueforti thoạt đầu là một loài hỗn tạp của nấm xanh sinh bào tử. Chúng được chia thành các nhóm loài khác nhau dựa trên sự khác biệt về kiểu hình, và sau đó chúng được kết hợp thành một loài bởi Raper và Thom.
Nhóm Pencillium được phân loại lại vào năm 1996 dựa vào sự khác nhau của dãy DNA ribosom và đặc tính chuyển hoá thứ cấp. Trước đây được chia thành hai loại khác nhau – một là được dùng cho phomat ( Penicillium roqueforti var. roqueforti) và một là tạo patulin.
32 trang |
Chia sẻ: ngtr9097 | Lượt xem: 3043 | Lượt tải: 5
Bạn đang xem trước 20 trang tài liệu Nấm Mốc Penicilium, để xem tài liệu hoàn chỉnh bạn click vào nút DOWNLOAD ở trên
ĐỀ TÀI
PENICCILIUM ROQUEFOTI
GVHD: K.S. PHẠM MINH NHỰT
NHÓM 7
TRẦN THUỴ KIM BÌNH
TRƯƠNG THỊ TRÚC HÀ
PHẠM NGÔ ÁNH THƯ
HUỲNH THỊ DIỆU HIỀN
MỤC LỤC
Lời nói đầu
Phần I
Tổng Quan Về Penicillium Roqueforti
Lịch sử phát hiện 4
Phân loại khoa học 4
Đặc điểm nhận dạng 6
Đặc điểm sinh hoá 9
Phần II
Các Phương Pháp Xác Định
Phương pháp truyền thống 8
Các phương pháp hiện đại
1. Phương pháp PCR 22
2. Phương pháp RAPD 25
Phần III: Kết Luận
LỜI NÓI ĐẦU
Trong những năm gần đây với sự tiến bộ của khoa học kỹ thuật, quá trình định danh cho nhiều loài vi sinh vật cũng như dễ dàng hơn với thiết bị hiện đại hơn. Nhiểu loại vi sinh có lợi, hại đều được biết đến rõ ràng hơn. Trong những năm vi sinh học phát triển một loài sinh độc tố nhưng có ít trong đó có loại nấm mốc Peniccilium roqueforti được xác định từ trong sản phẩm phomat xanh vốn quen thuộc với dân châu Âu. Penicilium roqueforti được các nhà khoa học tìm hướng đi mới ngoài việc sử dụng để sản xuất phomat xanh.
PHẦN I : TỔNG QUAN TÀI LIỆU
LỊCH SỬ PHÁT HIỆN
Đầu tiên được mô tả bởi Thom vào năm 1906, Penicillium roqueforti thoạt đầu là một loài hỗn tạp của nấm xanh sinh bào tử. Chúng được chia thành các nhóm loài khác nhau dựa trên sự khác biệt về kiểu hình, và sau đó chúng được kết hợp thành một loài bởi Raper và Thom.
Nhóm Pencillium được phân loại lại vào năm 1996 dựa vào sự khác nhau của dãy DNA ribosom và đặc tính chuyển hoá thứ cấp. Trước đây được chia thành hai loại khác nhau – một là được dùng cho phomat ( Penicillium roqueforti var. roqueforti) và một là tạo patulin.
PHÂN LOẠI KHOA HỌC
Giới: Nấm
Ngành: Ascomycota
Lớp: Eurotiomycetes
Bộ: Eurotiales
Họ: Trichocomaceae
Giống: Penicillium
Loài: Penicillium roqueforti
(Penicillium roqueforti var. carneum), Penicillium roqueforti được phân loại thành ba loài là Pencillium roqueforti, Penicillium carneum và Penicillium paneum.
ĐẶC ĐIỂM
Đặc điểm hình thái
Penicilium roqueforti là loại mốc có màu xanh, có cuốn đính bào từ, sinh bào tử, sinh sản hữu tính, hình sợi, thuộc ngành nấm nang.
Đặcđiểm bào tử
Bào tử của nấm mốc Penicilium roqueforti : hình cầu gần như hình tròn, bề mặt tròn nhẵn(kích thước 3,5- 5,5 µm), không có màng tế bào.
Cuống dài 100-200 x 4-5,5,….
Khuẩn lạc Penicilium roqueforti
Môi trường sống
Đặc điểm trên môi tổng hợp:
Penicillium roqueforti chỉ là một loài của Penicillium mà nó có thể phát triển trên môi trường chứa 0-5% acid acetic, ở nồng độ rượu cao, và ở nồng độ oxy thấp (nói rõ trong phần sau). Khuẩn lạc trên môi trường Czapek thạch và MEA 25oC phát triển rất nhanh chóng, đường kính đạt 4-5 cm, trong vòng 14 ngày, các bào tử có các cuống mọc dày đặc, mượt, Màu xanh xanh, sau đó trở nên tối hơn. Dịch tươi do loài này tiết ra trong như giọt pha lê. Mùi không rõ nét. Sau đó môi trường thay đổi màu sắc từ màu xanh sang xanh đậm. Cuống bào tử đính kích thích 100-200 x 4,0-6,5 μm. Hạt bào tử đính trong cột lỏng lẻo,hình cầu, màu xanh lục, nhẵn-tường, chủ yếu là từ 4-6 mm, có khi đến 8mm.
Phân bố trong tự nhiên:
Roqueforti Penicillium là một loại nấm hoại sinh phổ biến , nó thì tồn tại khắp nơi trong tự nhiên và có thể được phân lập từ đất, các chất hữu cơ phân hủy và các bộ phận của cây .. Ngoài ra, chúng được tìm thấy trong ẩm ướt, hầm tối, đến vườn đất và tán lá, mà còn trong phòng tắm, nước, đường ống, con dấu cao su, ngưỡng cửa sổ, thảm, nệm và đồ nội thất…
Tốc độ phát triển
Tốc độ phát triển nhanh trên các môi trường và đạt kích thước sau: CYA: 34-55mm, MEA: 35-56 mm, YES: 47-74 mm. Khuẩn lạc của Penicilium roqueforti phát triển rất tốt trên môi trường acid acetic : 0,5%, và cũng phát triển tốt trên CREA thích hợp trên môi trường acid.
ĐẶC TÍNH SINH HOÁ
Sinh hợp chất thứ cấp
Penicilium roqueforti là loài sinh ra hợp chất thứ cấp marcfortines và fumigaclvine A.
Những tư liệu về những hợp chất này tạm thời chưa được rộng nên khó khăn trong việc lấy nó làm tư liệu.
Độc tố PR và eremofortin C
Là chất chuyển hóa thông thường của Penicilium roqueforti. Các cấu trúc hóa học của hai hợp chất liên quan chặt chẽ với nhau và khác nhau chỉ bởi một aldehyde và một nhóm acohol tại vị trí C-12 .
Định tính, định lượng độc tính enzyme:
Các hoạt động tối đa các enzym trong các môi trường đã được tìm thấy vừa xảy ra vào ngày 13 tính từ khi bắt đầu thí nghiệm, trong đó tương ứng cực đại của PR trong vật chứa độc tố. Enzyme này được phân lập và tinh chế từ các môi trường và vừa khuẩn ty thể của nấm tương ứng thông qua một thao tác liên quan đến amoni sulfat và fractionation DEAE-cellulose sắc ký.
Sản lượng đã được 33,3 và 21,6% cho các enzym có hoạt tính trung. Độ pH tối ưu cho enzym khi pH 5,6. Khi nó xúc tác sự chuyển đổi ở 30 ° C và phân rã với thời gian phản ứng khi ở nhiệt độ cao. Ở 100 ° C, hoạt động của enzyme đã hoàn toàn bị mất. Các K. và Vmax của các enzym như được xác định ở 30 ° C là 0,02 mM và 4.0, umol / phút mỗi mg, tương ứng. Trọng lượng phân tử của enzyme đã được ước tính bằng cách lọc ,áp suất sắc ký lỏng thu được là I-250 protein đến 40.000. Độc tố PR và eremofortin C (EC) là chất chuyển hóa thứ cấp của nấm Penicillium roqueforti, những độc tố này gây nguy hiểm cho những người sử dụng sản phẩm phomat bị nhiễm penicilium roqueforti.
Hình: phân tích chất độc bằng phương pháp HPLC . sự hoạt động của độc tính trong Penicilium roqueforti.
Kể từ khi phát hiện và cô lập PR độc tố , nó làm sáng tỏ độc tố nấm mốc con đường tổng hợp sinh học của các độc tố khác có liên quan và chuyển hóa qua lại lẫn nhau.
Cấu trúc của PR :
Oxy hoá các acib béo
Khả năng của nấm để ôxi hóa của các axit béo chuỗi trung bình được thu Ketones methyl lần đầu tiên được ghi nhận, người đã cho thấy Penicillium roqueforti và hai loài của chi Aspergillus sản xuất Ketones methyl khi nuôi vi nấm trong vài tuần trong môi trường acid béo. Năng lực của các bào tử của P. roqueforti để tạo Ketones methyl nhanh chóng biến mất dần dần khi bào tử nảy mầm.Tỷ lệ sự hình thành của 1-2-heptan trong những axít octanoic do sự không hoạt động P.roqueforti đã được tăng lên đáng kể bằng cách thêm những axít amin và đường khi kích thích nảy mầm của các bào tử.
Phương pháp:
Gehrig & Knight (1963) đã tăng trưởng của khuẩn ty thể Penicillium roqueforti trên phương diện hóa học trong đó có cả acetate và oleate. Ban đầu ở pH 4,0 thể khuẩn ty ở pH 4,0 lần ít hoạt động trong ôxi hóa axít béo hơn khoảng 5 sự phát triển ở pH 6,5.
Môi trườngAmmonium nitrate, 2 g. ; Magiê sulfat (MgSO,. 7H, O), 0,1 5 g. ; Kali clorua, 0,25 g. ; Sắt sulfat (FeSO,. 7H20), 0,0125 g.
Tăng trưởng của khuẩn ty thể:
Bào tử của Penicillium roqueforti đã được nhân giống trên môi trường Czapek-Dox agar (Oxoid) . Sau 5-6 ngày các bào tử đã được chuyển giao cho 100 ml của trung bình trong 500 ml trong Erlenmeyer Flasks. Việc nhân giống được ủ qua đêm, để cho phép bào tử nảy mầm trong 24 giờ. Nồng độ của khuẩn ty thể pha trộn đã được điều chỉnh để khoảng 10 mg. / ml. Wt khô, nồng độ chính xác được xác định bằng cách đo lường trọng lượng khô.
Hình 1: Sự hấp thu oxy ở pH 5,2 do khuẩn ty thể của roqueforti Penicillium ủ với axít béo. Phản ứng các điều kiện: Iomg. khô wt equiv. khuẩn ty thể, thu hoạch sau khi 66h.
Hình 2: Các ức chế hấp thu oxy bằng cách bổ sung của C, hoặc C, các axit béo để khuẩn ty thể của Penicillium roquefortiincubated với axít béo
Kết quả:
Ảnh hưởng trung vào khả năng tăng trưởng của khuẩn ty thể để ôxi hóa axít béo . Sản lượng của Ketones methyl thấp từ axit béo đã thu được với khuẩn ty thể trồng trong các axit Casamino (3 g./500 ml).
Độc tính:
Penicilium roqueforti sinh độc tố roquefortine. Độ độc thấp của roquefortine C đã được tìm thấy trong pho mát xanh nhưng nồng độ chính xác đã không báo cáo. Scott và Kennedy (1976) tìm thấy nồng độ roquefortine lên đến 6,8 mg / kg trong các mẫu phó mát xanh trên thị trường mà họ kiểm tra. Trong thực tế,độc tính roquefortine tạo ra bởi hầu hết các chủng của P. roqueforti được phân lập từ phô mai xanh. Một tỷ lệ nhỏ các chủng tìm thấy từ thịt cũng tạo ra roquefortine.
Khả năng gây bệnh của Penicillium roqueforti là rất thấp, thậm chí là ít cơ hội gây bệnh. Giá trị LD50 của roquefortine khoảng 10 mg / kg được thử nghiệm trên chuột. Cho bò ăn ngô bị nhiễm P. roqueforti làm bò biếng ăn, và viêm đường ruột .
Con người tiếp xúc độc tính đó qua da và đường hô hấp và tiêu hoá
Một trường hợp được Campbell et al (1983) mô tả về một bệnh nhân làm việc tại một nhà máy, nơi pho mai xanh được sản xuất bằng cách sử dụng. Penicillium roqueforti. Triệu chứng là ho, khó thở, khó chịu, thể tích phổi giảm. Penicillium Roqueforti có thể gây ra phản ứng dị ứng như sổ mũi, ho, hắt hơi, nổi mề đay, hoặc bệnh suyễn.. Không có bằng chứng để kết luận độc tính roquefortine có khả năng gây ung thư.
ỨNG DỤNG
Sản xuất poliscchacarides, sản xuất hợp chất thứ cấp,….
Sản xuất Exo-polygalacturonase (Exo-p):
Dựa trên môi trường kem dầu bí ngô (PuOC ) kết hợp bổ sung lúa mì, cám (WB), và vi nấm mốc Penicilium roqueforti, nhằm thực hiện quá trình lên men bề mặt bán rắn SSF.
Hình trên cho thấy : Khả năng tổng hợp của Penicilium roqueforti sản sinh Exo- P, trên môi trường PuoC. Exo-P tăng từ đầu quá trình và đạt những giá trị tối đa là 1452U/g.d.w.
Sản xuất protease trong sản xuất phomat xanh, Roquefort, Stilton
Khả năng tổng hợp protease có khả năng đông tụ sữa sử dụng trong sản xuất các sản phẩm lên men từ sữa và protein
2.1. Phomat xanh(Stilton):
Stilton là một pho mát kem với làn vân màu xanh, và nó có một hương vị đặc trưng, với khả năng chống oxy hoá. Stilton là một loại phomat làm từ sữa tiệt trùng. Sữa được bổ sung nấm mốc roqueforti, thêm muối và không ép khuôn để sản phẩm có kết cấu lỏng lẽo, để nấm mốc phát triển tự nhiên ăn lan thành các đường vân trước khi thành phẩm.
2.2. Roquefort
Roquefort là sản phẩm lên men từ sữa cừu hoà với nước nóng ở 32o C , sản phẩm đông tụ nhờ các enzyme protease( trong đó một là pepsin), giai đoạn này người ta bổ sung vi nấm Penicilium roqueforti
Phô mai này sau đó tăng trưởng và phát triển ở nhiệt độ thích hợp là 8oC, với điều kiện nhiệt độ. Roquefort sinh trưởng thoát hơi CO2 trong quá trình lên men.
Sản phẩm sau đó được đóng gói và bảo quản trong điều kiện thiếu O2.
PHẦN II: PHƯƠNG PHÁP XÁC ĐỊNH
XÁC ĐỊNH BẰNG PHƯƠNG PHÁP TRUYỀN THỐNG
Phân tích định tính
Quy trình:
Đồng nhất mẫu trong SDB thành độ pha loãng 10-1, ủ ở 30o trong 1- 7 ngày
↓
Cấy canh trường có mốc mọc lên đĩa SDA, MEA hay PDA ủ ở 30o C trong 7 ngày
↓
Kết luận có hay không có nấm mốc phát triển.
Sơ đồ: quy trình định tính nấm mốc
Thuyết minh quy trình:
- Môi trường sử dụng:
SDB: Sabouraud’s Dextrose Broth . Thành phần môi trường gồm có:
Polypeptone hoặc neopeptone :10g
Dextrone: 40 g
Nước cất: 1000ml. ph= 5,8.
SDA: như môi trường SDB trên nhưng thêm 15- 20g agar. Phân phối vào đĩa petri sau khi hấp khử trùng.
MEA: malt extract agar
Cao malt 30g
Agar 20g
Nước cất 1000ml
Hấp khử trùng, phân phối vào đĩa petri. pH= 5,5
Hình ảnh:a) khuẩn lạc sau một tuần trên. Hình c,d: miếng phó mát Roquefort trong đó khuôn được thấy như tĩnh mạch sẫm màu (màu xanh) trong phô mai.
PDA: Potato Dextrose Agar. Thành phần:
Potato infusion 200g
Dextrone 20 g
Agar 20g
Nước cất 1000ml.
Môi trường trên chỉ xác định nấm mốc, muốn định danh Penicilium roqueforti cần môi trường CYA(môi trường thạch Czapek Yeast Autolysate), YES. Khuẩn lạc phát triển trên môi trường CYA: làm môi trường chuyển từ màu vàng kem sang màu nâu nhạt. Khuẩn lạc có màu xanh nhạt.Trên môi trường YES: khuẩn lạc làm môi trường từ vàng nhạt sang màu nâu. Khuẩn lạc có màu xanh lục.
Phân tích định lượng:
Quy trình:
Đồng nhất và pha loãng mẫu 10-1, 10-2, 10-3, 10-4….
↓
Trãi 0,1 ml mẫu lên đĩa DRBC hoặc DG18, ủ ngữa đĩa ở 25oC, 5-7 ngày
↓
Đếm khuẩn lạc nấm mốc, tính mật độ(CFU/g)
↓
Cấy lên môi trường ống thạch nghiêng SDA, ủ 30 độ, 7 ngày
↓
Định danh( môi trường CYA, YES)
Môi trường:
DGBC: Dichloran Rose Bengal Chloramphenicol agar. Thành phần gồm có:
Glucose 10g
Peptone 5g
KH2PO4 1g
MgSO4 0,5g
Rose bengal( dung dich5 5%, w/w trong ethanol) 1ml
Dichloran (0,2%(w/w) trong ethanol) 1ml(2,6- dichhloro-4- nitroaniline)
Chloramphenicol 0,1g
Agar 15g
Nước cất 1000ml
Ph= 5,6. Môi trường đỗ đĩa petri.
Môi trường DG18: dichloran 18% glycerol agar. Thành phần:
Glucose 10g
Petone 5g
KH2PO4 1g
Dichloran (0,2%(w/w) trong ethanol) 1ml(2,6- dichhloro-4- nitroaniline)
MgSO4 0,5g
Chloramphenicol 0,1g
Glycerol 220g
Nước cất 800ml
Agar 15g.
Hai môi trường trên pha lẫn các chất trừ chloramphenicol, hấp khử trùng, để nguội 50 độ sau đó thêm chloramphenicol(1ml/100ml môi trường), Glycerol 220g.
Tiến hành định danh cho loài nấm mốc Penicilium roqueforti bằng môi trường CYA,YES.
XÁC ĐỊNH P.ROQUEFORTI BẰNG PHƯƠNG PHÁP HIỆN ĐẠI
Xác định bào tử Penicilium roqueforti bằng phương pháp PCR
Phương pháp lấy mẫu không khí tích hợp và phân tích DNA để phát hiện các bào tử nấm Penicilium roqueforti.
Tóm tắt:
Bào tử P.roqueforti được thu thập trực tiếp vào ống Eppendorf sau đó ngâm huyền phù trong dung dịch 0,1% Nonidet P-40 và được tính bằng cách sử dụng kính hiển vi, dung dịch sẽ pha loãng mẫu với các nồng độ pha loãng khác nhau tuỳ theo số bào tử đếm được. Ba phương pháp đã được sử dụng sản xuất DNA để thử nghiệm PCR: thêm các bào tử chưa bất hoạt để PCRs, ) sử dụng các hạt Ballotini phá vỡ các bào tử (khe nứt của bức tường bào tử để phát phản ứng), và phá vỡ các bào tử DNA sau tinh chế. Số lượng thêm các bào tử bất hoạt vào không được nhỏ hơn 1000. Sau đó bằng cách phá vỡ các bào tử, có hoặc không có tinh chế DNA, Penicilium roqueforti đã có thể phát hiện DNA từ một bào tử duy nhất. P. roqueforti bào tử được thêm vào từ không khí các mẫu nồng độ cao của các bào tử nấm không rõ nguồn gốc: phấn hoa, bụi đã làm giảm độ nhạy phát điện. Tuy nhiên, bằng cách sử dụng DNA tinh khiết, nó đã có thể phát hiện 10 loại bào tử P. Đối với tất cả các phương pháp tách chiết DNA, PCR lồng nhau được nhạy cảm hơn so với bước đơn PCR hoặc PCR theo sau phương pháp Southern blotting.
Vật liệu và phương pháp:
Kết quả và định lượng P. roqueforti spores. roqueforti bào tử: phản ứng xác định số lượng bào tử trên chủng P. roqueforti C2709 cô lập từ hạt lúa mì tại Rothamsted(Anh), Nó được cấy trên bông thấm bấc ngâm trong dextrose agar khoai tây (Oxoid Ltd, Basingstoke, Vương quốc Anh) và ủ ở 25 ° C. Các bào tử đã được ngâm điều chỉnh để 2 × 10 4 bào tử / ml, pha loãng với cơ số log 10.
Chuẩn bị mẫu Air spiked( mẫu trong dịch huyền phù) để kiểm tra hiệu quả của chất nền: sử dụng cơn bão thu nhỏ lấy mẫu không khí đã được sử dụng để thu thập mẫu từ không khí xung quanh thành ống Eppendorf khoảng 1,5 ml( mẫu không khí đã được lưu giữ khô ở nhiệt độ phòng cho đến khi sử dụng). Các mẫu thu thập được treo huyền phù trong 1 ml 0,1% Nonidet P-40 của vortexing trong 2 phút. Các mẫu pha loãng ở nồng độ khoảng 9 × 10 5 / ml.
Tinh sạch DNA P.roqueforti và hệ sợi của nó:
Bốn phương pháp chuẩn bị mẫu được sử dụng cho phân tích PCR :
( 5 μL của dịch huyền phù bào tử được thêm vào ống PCR
( 200 μL của dịch huyền phù được phá vỡ và 5 μL bào tử đã được thêm vào ống PCR
( DNA được chiết xuất từ 50 μL của các mẫu bào tử bị phá vỡ, một phần đã được hòa tan trong 50 μL của nước cất vô trùng, và 5μL của dịch huyền phù, kết quả DNA đã được thêm vào ống PCR
(50 μL của dịch huyền phù được phá vỡ bào tử, DNA được tách ra và hòa tan trong 5μL của nước cất vô trùng, và toàn bộ các mẫu đã được thêm vào ống PCR
Cách 3 được gọi là chiết xuất DNA quy mô lớn, và cách 4 được gọi là chiết xuất DNA quy mô nhỏ.
Sự phá vỡ các bào tử bằng cách lắc treo bào tử với 0,2 g acid-rửa hạt Ballotini (8,5point, đường kính 400-455 μm) cho 8 phút trong một máy nghiền. Kiểm tra mẫu của bào tử huyền phù bằng kính hiển vi, trước và sau khi các phương thực hiện cho thấy rằng chúng bị gián đoạn hơn 90% của bào tử P. roqueforti. Điều này liên quan đến việc trộn các mẫu với một vùng đệm ức chế (có chứa Tris, EDTA, sodium dodecyl sulfate, và β-mercaptoethanol), ủ chúng ở 65 ° C cho 1 h, và sau đó thực hiện khai thác phenol-chloroform và lượng isopropanol. Chúng tôi đổi cách thực hiện bằng cách thêm 20 ng của glycogen ở bước thêm isopropanol trong quá trình ly tâm. DNA cũng được chiết xuất từ sợi nấm của P. roqueforti
Phát hiện của P. roqueforti DNA by PCR. roqueforti DNA bằng PCR:
Đoạn mồi: người ta sử dụng 2 loại đoạn mồi một là ITS4 ( 5’TCCTCCGCTTAGATATGC) và ITS5 ( 5’AGTAAAAGTCGTAACAAGG) hai là ITS183 (5′CTGTCTGAAGAATGCAGTCTGAGAAC) và ITS401 (5′CCATACGCTCGAGGACCGGAC)
Những mồi khuyếch đại một vùng DNA kéo dài từ cuối đầu '3 của gen 18 đến hết đầu 5' của gen 28S. Each 25-μl reaction mixture contained 25 pmol of both primers, 0.5 U of Platinum Taq (Life Technologies, Ltd., Paisley, United Kingdom), buffer (20 mM Tris HCl [pH 8.4], 50 mM KCl, 1.5 mM MgCl 2 ), 0.2 mM deoxyribonucleoside triphosphates, and DNA (various amounts from log 10 dilutions of P. roqueforti spores and 5 to 50 ng from mycelium or spores of other fungi). Mỗi 25μL hỗn hợp của phản ứng có 25 pmol cả hai đoạn mồi, 0,5 U của Platinum Taq, đệm (20 mM Tris HCl [pH 8,4], 50 mM KCl, 1,5 mM MgCl 2 ), 0,2 mM triphosphates deoxyribonucleoside, và DNA dung dịch pha loãng của bào tử P. roqueforti và 5-50 ng mycelium hoặc bào tử của nấm khác. Điều kiện chu kì bào tử được 95 ° C trong 10 phút và nhiệt độ 94 ° C trong 30 s, 42 ° C trong 2 phút, và 72 ° C trong 2 phút.
Kết hợp PCR và Southern blotting: đó là phương pháp kết hợp để cho một kết quả chính xác hơn là chỉ xác định dựa trên một kết quả từ 1 phản ứng PCR.
Kết quả:
Khuếch đại một đoạn 300-bp của DNA từ bào tử P. roqueforti bằng phương pháp nested PCR. Kết quả từ 1-4, 0, 100, 1.000, và 10.000 bào bổ sung vào các PCR; dãy 5-8, 0, 10, 100, và 1.000 bào tử phá vỡ thêm vào các PCR; dãy 9-12, DNA từ 0, 1 , 10, và 100 bào tử tinh chế bằng phương pháp khai thác trên quy mô lớn; dãy 13-16, DNA từ 0, 1, 10, và 100 bào tử tinh chế bằng phương pháp khai thác trên quy mô nhỏ; dãy 17, DNA P. roqueforti roqueforti lấy từ khuẩn ty thể, dãy 18, nước, dãy 19 là kích thước DNA marker (100-bp ).
Xác định bằng phương pháp RAPD
Là phương pháp sửa đổi những thủ tục PCR của Saiki (1990) sử dụng phổ mồi NS2, 3, 5 và 7 và các sửa đổi sau đây: 200 của mồi trong 50 p1 phản ứng hỗn hợp, 0,25% Tween 20, 10% (v / v) DMSO, 10 của gen DNA. Biến tính ban đầu tại 94 oC cho 1 phút tiếp theo là 40 chu kỳ của 94 oC cho 10 s, 40 "C trong 60 s, 72 oC cho 60 s, trên một Tap polymerase. Cuối cùng, nhiệt độ đã được lưu giữ tại 72 "C trong 10 phút. Taq polymerase (AmpliTaq. Vân tay là hình tượng của UV sau khi chạy PCR pl 10 sản phẩm trên một 15 cm, 2,0% (w / v) agarose gel cho 4 giờ ở 90 mA và nhuộm với ethidium bromua. Kỹ thuật fingerprinting được thực hiện ít nhất ba lần cho mỗi cô lập.
Các bước tiến hành kĩ thuật RAPD:
Bước 1: Tách chiết DN