Cà rốt (Daucus carota L. Him) hiện nay được trồng và tiêu thụ rộng rãi trên
thế giới nhờ có giá trị dinh dưỡng và giá trị trong y học cao (Chen et al., 2016).
Ở Việt Nam, Lâm Đồng và Hải Dương có diện tích trồng tập trung lớn nhất. Tuy
nhiên, tại các vùng trồng chuyên canh cà rốt đã xuất hiện thiệt hại do tuyến trùng
thực vật gây ra ảnh hưởng đến năng suất chất lượng. Hiện nay, ở Việt Nam, chưa
có nhiều nghiên cứu sâu về thành phần tuyến trùng ký sinh gây hại trên cà rốt.
Để phòng trừ tuyến trùng ký sinh gây hại trên cà rốt, biện pháp sử dụng
thuốc hóa học vẫn là chủ yếu. Tuy nhiên, việc lạm dụng thuốc hóa học đã và
đang gây ra những hậu quả tiêu cực đến môi trường sống, sức khỏe con người
và các sinh vật khác (Meira et al. 2006). Biện pháp sinh học là một trong
những biện pháp hiệu quả trong phòng trừ tuyến trùng thực vật và an toàn với
môi trường (Perry & Moens, 2013). Vì vậy, việc lựa chọn những sản phẩm
sinh học thân thiện với môi trường để phòng trừ tuyến trùng là rất cần thiết.
Với mục đích nghiên cứu thành phần loài và nhóm tuyến trùng gây hại
quan trọng trên cà rốt, đánh giá thử nghiệm biện pháp sinh học trong phòng trừ
tuyến trùng tạo cơ sở cho việc quản lý dịch hại tuyến trùng trên cà rốt, chúng
tôi tiến hành thực hiện đề tài nghiên cứu: “Tuyến trùng ký sinh gây hại trên
cà rốt ở Việt Nam và thử nghiệm biện pháp sinh học trong phòng trừ chúng”
Mục tiêu của luận án
- Xác định được thành phần loài tuyến trùng ký sinh trên cà rốt ở các vùng
trồng cà rốt chính ở Việt Nam.
- Xác định được nhóm tuyến trùng ký sinh gây hại quan trọng trên cà rốt ở
các vùng nghiên cứu.
- Đánh giá được khả năng phòng trừ trong phòng thí nghiệm một số loài tuyến
trùng ký sinh gây hại quan trọng trên cà rốt bằng các loài nấm đối kháng
27 trang |
Chia sẻ: thientruc20 | Lượt xem: 610 | Lượt tải: 2
Bạn đang xem trước 20 trang tài liệu Tóm tắt Luận án Tuyến trùng ký sinh gây hại trên cà rốt ở Việt Nam và thử nghiệm biện pháp sinh học trong phòng trừ chúng, để xem tài liệu hoàn chỉnh bạn click vào nút DOWNLOAD ở trên
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC
VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM
HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
-----------------------------
NGUYỄN THỊ DUYÊN
TUYẾN TRÙNG KÝ SINH GÂY HẠI TRÊN CÀ RỐT Ở VIỆT NAM
VÀ THỬ NGHIỆM BIỆN PHÁP SINH HỌC TRONG
PHÒNG TRỪ CHÚNG
Chuyên ngành: Tuyến trùng học
Mã số: Thí điểm
TÓM TẮT LUẬN ÁN TIẾN SỸ SINH HỌC
Hà Nội – 2018
2
Công trình được hoàn thành tại: Học viện Khoa học và Công nghệ -
Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam.
Người hướng dẫn khoa học 1: PGS. TS. Nguyễn Ngọc Châu
Người hướng dẫn khoa học 2: TS. Trịnh Quang Pháp
Phản biện 1:
Phản biện 2:
Phản biện 3: .
Luận án sẽ được bảo vệ trước Hội đồng đánh giá luận án tiến sĩ cấp
Học viện, họp tại Học viện Khoa học và Công nghệ - Viện Hàn lâm
Khoa học và Công nghệ Việt Nam vào hồi giờ ..’, ngày tháng
năm 201.
Có thể tìm hiểu luận án tại:
- Thư viện Học viện Khoa học và Công nghệ
- Thư viện Quốc gia Việt Nam
3
MỞ ĐẦU
Cà rốt (Daucus carota L. Him) hiện nay được trồng và tiêu thụ rộng rãi trên
thế giới nhờ có giá trị dinh dưỡng và giá trị trong y học cao (Chen et al., 2016).
Ở Việt Nam, Lâm Đồng và Hải Dương có diện tích trồng tập trung lớn nhất. Tuy
nhiên, tại các vùng trồng chuyên canh cà rốt đã xuất hiện thiệt hại do tuyến trùng
thực vật gây ra ảnh hưởng đến năng suất chất lượng. Hiện nay, ở Việt Nam, chưa
có nhiều nghiên cứu sâu về thành phần tuyến trùng ký sinh gây hại trên cà rốt.
Để phòng trừ tuyến trùng ký sinh gây hại trên cà rốt, biện pháp sử dụng
thuốc hóa học vẫn là chủ yếu. Tuy nhiên, việc lạm dụng thuốc hóa học đã và
đang gây ra những hậu quả tiêu cực đến môi trường sống, sức khỏe con người
và các sinh vật khác (Meira et al. 2006). Biện pháp sinh học là một trong
những biện pháp hiệu quả trong phòng trừ tuyến trùng thực vật và an toàn với
môi trường (Perry & Moens, 2013). Vì vậy, việc lựa chọn những sản phẩm
sinh học thân thiện với môi trường để phòng trừ tuyến trùng là rất cần thiết.
Với mục đích nghiên cứu thành phần loài và nhóm tuyến trùng gây hại
quan trọng trên cà rốt, đánh giá thử nghiệm biện pháp sinh học trong phòng trừ
tuyến trùng tạo cơ sở cho việc quản lý dịch hại tuyến trùng trên cà rốt, chúng
tôi tiến hành thực hiện đề tài nghiên cứu: “Tuyến trùng ký sinh gây hại trên
cà rốt ở Việt Nam và thử nghiệm biện pháp sinh học trong phòng trừ chúng”
Mục tiêu của luận án
- Xác định được thành phần loài tuyến trùng ký sinh trên cà rốt ở các vùng
trồng cà rốt chính ở Việt Nam.
- Xác định được nhóm tuyến trùng ký sinh gây hại quan trọng trên cà rốt ở
các vùng nghiên cứu.
- Đánh giá được khả năng phòng trừ trong phòng thí nghiệm một số loài tuyến
trùng ký sinh gây hại quan trọng trên cà rốt bằng các loài nấm đối kháng.
Ý nghĩa khoa học và thực tiễn
Ý nghĩa khoa học:
- Đã xác định được thành phần, phân bố các loài tuyến trùng ký sinh trên cà
rốt ở một số vùng canh tác cà rốt ở Việt Nam và bổ sung thành phần tuyến trùng
ký sinh trên cây cà rốt đối với thế giới. Cung cấp, bổ sung dữ liệu hình thái và
phân tử của các nhóm tuyến trùng ký sinh gây hại quan trọng trên cà rốt. Đã
đăng ký trình tự 19 quần thể tuyến trùng ký sinh cà rốt ở Việt Nam trên Genbank.
- Ghi nhận và công bố 1 loài mới cho khoa học. Bổ sung một giống tuyến
trùng mới được ghi nhận ở Việt Nam. Ghi nhận thêm 16 loài tuyến trùng ký
sinh trên cà rốt ở Việt Nam.
- Xác định các nhóm tuyến trùng ký sinh gây hại quan trọng trên cà rốt ở các
vùng nghiên cứu.
4
- Bước đầu, đưa ra dẫn chứng khoa học về ảnh hưởng của dịch bào tử nấm
Paecilomyces sp. và dịch nhân nuôi nấm Lentinus squarrosulus đối với hai
loài tuyến trùng ký sinh gây hại quan trọng trên cà rốt trong phòng thí nghiệm.
Ý nghĩa thực tiễn:
- Việc xác định nhóm tuyến trùng gây hại chính trên cà rốt là cơ sở cho việc
lựa chọn giải pháp phòng trừ. Mô tả các triệu chứng cụ thể do tuyến trùng gây
ra trên củ cà rốt để có thể chẩn đoán nhanh. Xác định được các nhóm tuyến
trùng gây hại chính ảnh hưởng đến phẩm chất và chất lượng của cà rốt trong
trồng trọt cũng như thương phẩm ở Việt Nam.
- Đánh giá khả năng phòng trừ tuyến trùng ký sinh gây hại cà rốt của nấm đối
kháng làm cơ sở cho việc lựa chọn biện pháp phòng trừ sinh học hữu hiệu góp
phần giảm lượng thuốc hóa học, phát triển hệ sinh thái nông nghiệp bền vững.
- Những dẫn liệu về tuyến trùng ký sinh gây hại trên cà rốt trong luận án có
thể sử dụng làm nguồn tài liệu trong giảng dạy bệnh hại cà rốt, cũng như giúp
người nông dân có thể tham khảo trong quá trình sản xuất cà rốt.
Nội dung của luận án
Nội dung 1: Xác định thành phần loài tuyến trùng thực vật ký sinh trên cà rốt
dựa vào các đặc điểm hình thái và phân tử.
Nội dung 2: Xác định nhóm tuyến trùng thực vật gây hại quan trọng trên cà
rốt ở các vùng nghiên cứu.
Nội dung 3: Thử nghiệm khả năng phòng trừ của 2 loài nấm đối kháng
Paecilomyces sp. và dịch nhân nuôi nấm L. squarrosulus đối với nhóm tuyến
trùng gây hại chính trên cà rốt trong phòng thí nghiệm
Bố cục của luận án
Luận án gồm 156 trang, trong đó: mở đầu 6 trang, tổng quan 19 trang, đối
tượng và phương pháp nghiên cứu 9 trang, kết quả và thảo luận 120 trang, kết
luận và kiến nghị 2 trang. Luận án gồm 34 bảng, 49 hình, 268 tài liệu tham
khảo. Ngoài ra còn có danh mục các công trình công bố và phụ lục đi kèm.
CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN
1.1. Tình hình nghiên cứu tuyến trùng ký sinh gây hại cà rốt trên thế giới
1.1.1. Các nhóm tuyến trùng ký sinh quan trọng trên cà rốt
Tuyến trùng ký sinh trên cà rốt trên thế giới đã được tập trung nghiên cứu
từ những năm 50 thế kỷ trước. Các nghiên cứu chủ yếu tập trung ở khu vực
Châu Âu, Châu Mỹ và Châu Úc. Cho đến nay đã ghi nhận được 21 giống
tuyến trùng ký sinh trên cà rốt (Nobbs, 2003). Trong đó, tuyến trùng giống
Meloidogyne và Pratylenchus là nhóm gây hại phổ biển ở nhiều vùng canh tác
cà rốt như: Mỹ, Đức, Úc, Canada,. nhưng ít đề cập đến thành phần loài.
5
1.1.2. Phân loại hình thái và phân tử các tuyến trùng thực vật
Mô tả đặc điểm hình thái, hình thái lượng kết hợp với các kỹ thuật phân tích
đặc trưng phân tử giúp cho việc định loại đến loài được chính xác hơn. Phân
đoạn mở rộng D2D3 của vùng 28S rDNA được sử dụng để phân loại một số
giống tuyến trùng thực vật (Subbotin et al., 2008; Van Den Berg et al., 2015)
1.1.3. Khả năng phòng trừ tuyến trùng thực vật bằng nấm đối kháng
Nấm Paecilomyces spp. là nấm hoại sinh trong đất, được quan tâm và
nghiên cứu nhiều nhất, do tiềm năng ký sinh và khả năng kiểm soát tuyến
trùng thực vật tốt (Brand et al., 2010). Cơ chế của nấm Paecilomyces spp. là
ký sinh trực tiếp bởi sợi nấm (Jones et al., 1984), đồng thời sản sinh ra các hoạt
chất và enzyme có khả năng phân hủy lớp kitin bên ngoài trứng và tuyến trùng,
tạo điều kiện thuận lợi cho sợi nấm xâm nhập (Mukhtar et al., 2013).
Nấm L. squarrosulus là một loài nấm có thể ăn được, giàu dinh dưỡng
(Omar et al., 2011). Chưa có nghiên cứu về khả năng tiêu diệt tuyến trùng của
nấm L. squarrosulus. Tuy nhiên, trong dịch nhân nuôi nấm L. squarrosulus có
chứa hàm lượng enzyme chitinase cao, đây là enzyme phân hủy lớp vỏ và
trứng tuyến trùng (Deborah, 2018) và chứa hoạt chất kháng tuyến trùng 1,2 -
dihydroxymintlactone (Isaka et al., 2011), phenolic (Ghatr & Sridhar, 2017).
1.2. Tình hình nghiên cứu tuyến trùng thực vật ở Việt Nam
Ở Việt Nam, thành phần loài tuyến trùng ký sinh và gây hại trên cà rốt chưa
được nghiên cứu nhiều. Theo N.N. Châu & N.V. Thanh (2000), ghi nhận 12
loài tuyến trùng thuộc 4 giống ký sinh trên cà rốt ở Lâm Đồng. Ở Hải Dương,
V.Đ. Phiên (2014), đã xác định giống Meloidogyne và Pratylenchus gây hại
trên cà rốt ở Hải Dương. Phương pháp phân tích đặc điểm hình thái được đánh
giá đầu tiên trong chẩn loại đến loài tuyến trùng. Bên cạnh đó, các kỹ thuật
phân tử đã được áp dụng trong phân loại tuyến trùng, giúp cho việc định loại
đến loài chính xác hơn. Trên cơ sở phân tích DNA kết hợp với đặc điểm hình
thái, một số loài mới đã được công bố cho khoa học như: R. duriophilus,
R. daklakensis, M. daklakensis, (Trinh et al., 2004; 2012; 2018).
CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG, ĐỊA ĐIỂM VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
2.1. Đối tượng, địa điểm và thời gian nghiên cứu
2.1.1. Đối tượng nghiên cứu
- Tuyến trùng ký sinh trên rễ, củ cà rốt và đất xung quanh vùng rễ
- Cây cà rốt Daucus carota L. Him
- Hai loài nấm đối kháng được sử dụng trong thí nghiệm phòng trừ tuyến trùng
là: dịch bào tử nấm Paecilomyces sp. và dịch nhân nuôi nấm L. squarrosulus
6
2.1.2. Địa điểm và thời gian nghiên cứu
- Quá trình khảo sát, điều tra tình trạng tuyến trùng ký sinh trên cà rốt tại các
vùng canh tác chính thuộc 4 tỉnh là: Đông Anh (Hà Nội); Cẩm Giàng và Nam
Sách (Hải Dương); Văn Giang (Hưng Yên); Đức Trọng, Đơn Dương và Đà Lạt
(Lâm Đồng). Nghiên cứu được thực hiện tại Viện Sinh thái và Tài nguyên Sinh
vật. Luận án được tiến hành từ tháng 10/2014-10/2018.
2.2. Phương pháp nghiên cứu
2.2.1. Phương pháp điều tra, thu mẫu tuyến trùng
Điều tra thành phần loài được thu mẫu ngẫu nhiên theo phương pháp 5
điểm chéo góc (N.N. Châu, 2003; Perry & Moens, 2013).
2.2.2. Phương pháp tách lọc tuyến trùng từ đất và mô thực vật
Tuyến trùng được tách lọc từ đất và rễ theo phương pháp được mô tả bởi
N.N. Châu và N.V. Thanh (1993).
2.2.3. Phương pháp nhân nuôi tuyến trùng
- Tuyến trùng sần rễ giống Meloidogyne được nhân nuôi trên cây cà chua
theo mô tả của López-Pérez et al. (2011) có hiệu chỉnh.
- Tuyến trùng gây tổn thương rễ thuộc giống Pratylenchus được nhân nuôi
trên các đĩa cà rốt theo phương pháp của Coyne et al. (2014).
2.2.4. Phương pháp xử lý, làm trong và làm tiêu bản tuyến trùng
Tuyến trùng được cố định theo phương pháp của Courtney et al. (1995),
làm trong và lên tiêu bản cố định theo mô tả được đề cập bởi N.N. Châu (2003).
2.2.5. Phương pháp chuẩn bị mẫu chụp ảnh KHV điện tử quét
Xử lý mẫu tuyến trùng để quan sát và chụp ảnh hiển vi điện tử quét được
thực hiện theo quy trình của Abolafia (2015).
2.2.6. Các chỉ số đo hình thái trong phân loại tuyến trùng
Các chỉ số hình thái lượng thực hiện theo Siddiqi (2000). Tuyến trùng phân
loại theo khóa phân loại của N.N. Châu & N.V. Thanh (2000), Castillo &
Vovlas (2007), Kazachenko & Mukhina (2013), Geraert (2010; 2011),
Chitambar & Subbotin (2014).
2.2.7. Phương pháp phân tích phân tử tuyến trùng
Tách chiết DNA theo Holterman et al. (2009). PCR khuếch đại vùng gene
theo De Ley et al. (1999). Sản phẩm PCR được tinh sạch bằng kít GeneJet
PCR Purification và được gửi giải trình tự ở Công ty Macrogen - Hàn Quốc.
2.2.8. Phương pháp thử nghiệm đánh giá hiệu lực phòng trừ tuyến trùng
của nấm đối kháng
Thí nghiệm đánh giá hiệu lực phòng trừ tuyến trùng của nấm đối kháng
được tiến hành theo phương pháp mô tả bởi Pau et al. (2012).
7
2.2.9. Phân tích số liệu
Xử lý số liệu theo các phần mềm: i) phân tích hình thái lượng: Microsoft Excel,
GENSTAT 12 (Payne et al., 2009); ii) phân tích trình tự DNA: chương trình
BLAST, BioEdit (Hall, 1999), MEGA 6 (Tamura et al., 2013); iii) phân tích sai
khác giữa các công thức thí nghiệm đối kháng: SPSS.
CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN
3.1. Thành phần loài tuyến trùng ký sinh trên cà rốt ở Việt Nam
Kết quả phân loại hình thái và phân tử tuyến trùng ký sinh cà rốt đã xác
định 25 loài, thuộc 15 giống, 9 họ, 4 bộ (bảng 3.1).
Bảng 3.1. Thành phần loài tuyến trùng ký sinh trên cà rốt ở các vùng điều tra
TT Tên loài HN HD HY LĐ
BỘ TYLENCHIDA THORNE, 1949
Họ Belonolailidae Whitehead, 1960
Giống Tylenchorhynchus Cobb, 1913
1 T. mashhoodi Siddiqi & Basir, 1959 + +
2 T. annulatus Golden, 1971 + + + +
Họ Hoplolaimidae Filipjev, 1934
Giống Helicotylenchus Steiner, 1945
3 H. dihystera (Cobb. 1893) Sher, 1961 +
4 H. indicus Siddiqi, 1963 + + +
Giống Hoplolaimus Von Daday, 1905
5 H. chambus Jairajpuri & Baqri, 1973 +
Giống Rotylenchulus Linford & Oliveira, 1940
6 R. reniformis Linford & Oliveira, 1940 + + + +
Họ Anguinidae Nicol, 1935 (1926)
Giống Ditylenchus Filipjev, 1936
7 Ditylenchus sp. + + + +
Họ Criconematidae Thorne, 1949
Giống Hemicriconemoides Chitwood & Birchfield, 1957
8 H. strictathecatus Esser, 1960 + +
Giống Hemicaloosia Ray & Das, 1978
9 Hemicaloosia sp. +
Giống Mesocriconema Andrássy, 1965
10 M. sphaerocephalum (Taylor, 1936) Loof, 1989 + +
Họ Meloidogynidae Filipjev, 1934
Giống Meloidogyne Goeldi, 1892
8
11 M. incognita Chitwood, 1949 + + + +
12 M. arenaria Chitwood, 1949 +
13 M. graminicola Golden & Birchfield 1965 +
Họ Pratylenchidae Thorne, 1949
Giống Pratylenchus Filipjev, 1936
14 P. thornei Sher & Allen, 1953 +
15 P. zeae Graham, 1951 + +
16 P. haiduongensis Nguyen et al., 2017 +
17 P. coffeae Filipjev & Sch. Stekhoven, 1941 +
18 P. penestran Filipjev & Sch. Stekhoven, 1941 +
19 Pratylenchus sp. 1 +
20 Pratylenchus sp. 2 +
BỘ DORYLAIMIDA PEARSE, 1942
Họ Longidoridae Thorne, 1935
Giống Longidorus Micoletzky, 1922
21 Longidorus sp. +
Giống Paralongidorus Siddiqi, 1974
22 Paralongidorus sp. +
Giống Xiphinema Cobb, 1913
23 X. brevicolle Lordello & Da Costa, 1961 +
BỘ TRIPLONCHIDA COBB, 1920
Họ Diphterophoridae (Micoletzki, 1922)
Giống Diphterophora de Man, 1880
24 Diphterophora sp. + +
BỘ APHELENCHIDA SIDDIQI, 1980
Họ Aphelenchoididae Skarbilovich, 1947
Giống Aphelenchoides Fischer, 1894
25 Aphelenchoides sp. +
Ghi chú: (+) sự hiện diện của tuyến trùng; HN: Hà Nội, HD: Hải Dương, HY: Hưng
Yên và LĐ: Lâm Đồng
Trong đó, tuyến trùng ký sinh trên cà rốt ở Hải Dương có số lượng giống
và loài nhiều nhất với 16 loài thuộc 12 giống, tiếp theo là Lâm Đồng đã ghi
nhận được 12 loài thuộc 10 giống, Hà Nội gồm 8 loài thuộc 7 giống và Hưng
Yên gồm 7 loài thuộc 7 giống. Các kết quả nghiên cứu cũng là những ghi nhận
đầu tiên về thành phần loài tuyến trùng ký sinh trên cà rốt tại Hà Nội, Hưng
Yên và Hải Dương.
Trong nghiên cứu này, trên cà rốt ở Lâm Đồng đã ghi nhận thêm 7 giống
là: Ditylenchus, Tylenchorhychus, Rotylenchulus, Meloidogyne, Hemicaloosia,
9
Xiphinema và Diphterophora. Trong số 15 giống tuyến trùng ký sinh được tìm
thấy ở 4 vùng điều tra, có 6 giống chưa từng được ghi nhận ở trên thế giới là:
Hemicriconemoides, Hemicaloosia, Hoplolaimus, Paralongidorus,
Diphterophora và Aphelenchoides.
3.2. Đặc điểm hình thái và phân tử các loài tuyến trùng ký sinh trên cà rốt
Đặc điểm hình thái, các chỉ số đo, ảnh chụp, đặc trưng phân tử, cây chủ và
phân bố của các loài tuyến trùng ký sinh trên cà rốt ghi nhận trong nghiên cứu
này được mô tả chi tiết và đầy đủ trong luận án.
3.2.1. Giống Tylenchorhynchus Cobb, 1913
Có 2 loài thuộc giống Tylenchorhynchus là T. annulatus và T. mashoodi.
Loài T. annulatus ghi nhận ở 3 vùng canh tác cà rốt là: Hà Nội, Hải Dương
và Lâm Đồng. Quần thể phân lập ở Hà Nội có kích thước cơ thể, chiều dài kim
hút, chiều dài từ đầu đến lỗ bài tiết và chiều dài thực quản lớn nhất. Cả ba
quần thể này đều có các đặc điểm hình thái và chỉ số đo tương đồng với quần
thể được mô tả bởi Geraert (2010). So với quần thể ở Việt Nam mô tả trước đó,
chỉ số a, c’ lớn hơn và kim hút ngắn hơn (N.N. Châu & N.V. Thanh, 2000).
Loài T. mashhoodi ghi nhận ở Hải Dương và Hưng Yên. Hai quần thể này
có khoảng biến thiên của kích thước cơ thể nhỏ hơn so với quần thể gốc của
loài (Siddiqi & Basir, 1959) và có kích thước cơ thể, chỉ số a nhỏ hơn so với
quần thể ở Việt Nam mô tả trước đó (N.N. Châu & N.V. Thanh, 2000).
Loài T. annulatus khác với loài T. mashhoodi ở các đặc điểm như: Loài
T. annulatus có kích thước của cơ thể, chiều dài từ đỉnh đầu đến vòng thần
kinh lớn hơn loài T. mashhoodi. Vùng đầu của loài T. annulatus không phân
biệt với đường viền cơ thể khác với loài T. mashhoodi hơi tách biệt với đường
viền cơ thể. Vị trí lỗ bài tiết của loài T. annulatus nằm ngang với phần eo thắt
của thực quản, còn lỗ bài tiết ở loài T. mashhoodi lùi về phía sau hơn nằm
ngang với cạnh trước hoặc gần giữa của thực quản tuyến. Loài T. annulatus có
đuôi dài, hình trụ, mút đuôi tròn rộng, túi chứa tinh tiêu giảm, không chứa tính
trùng và không tìm thấy con đực. Trong khi loài T. mashhoodi có đuôi ngắn,
hình chóp, mút đuôi hẹp, túi chứa tinh hình tròn, to, có chứa đầy tinh trùng và
có sự ghi nhận của con đực.
3.2.2. Giống Helicotylenchus Steiner, 1945
Có 2 loài thuộc giống Helicotylenchus được ghi nhận ký sinh trên cà rốt là
loài H. dihystera và H. indicus.
Loài H. dihystera được ghi nhận ở vùng canh tác cà rốt Hải Dương. So với
các quần thể của loài được mô tả bởi Sher (1966) và N.N. Châu & N.V.Thanh
(2000), quần thể loài H. dihystera phân lập từ cà rốt có khoảng biến thiên của
10
giá trị a, c và kim hút nhỏ hơn.
Loài H. indicus được ghi nhận ở 3 vùng canh tác cà rốt là: Hà Nội, Hưng
Yên và Lâm Đồng. Cả ba quần thể này đều có đặc điểm hình thái, số đo tương
đồng với quần thể gốc được mô tả bởi Siddiqi (1963), cũng như quần thể được
mô tả bởi N.N. Châu & N.V. Thanh (2000).
Loài H. indicus được phân biệt với loài H. dihystera ở vị trí của phasmid.
Phasmid của loài H. indicus nằm ở phía trước lỗ hậu môn từ 1 - 4 vòng cutin.
Trong khi loài H. dihystera có phasmid nằm ở vị trí cao hơn phía trước hậu
môn từ 8 - 11 vòng cutin.
3.2.3. Giống Hoplolaimus Von Daday, 1905
Giống này ghi nhận 1 loài là loài H. chambus với 1 cá thể ở vùng canh tác cà
rốt Hải Dương. Cá thể này có các đặc điểm hình thái và số đo tương tự với loài
gốc và quần thể ở Việt Nam được mô tả trước đó, ngoại trừ chỉ số b có giá trị
nhỏ hơn (Jairajpuri & Baqri, 1973; N.N. Châu & N.V. Thanh, 2000).
3.2.4. Giống Rotylenchulus Linford & Oliveira, 1940
Giống Rotylenchulus ghi nhận 1 loài R. reniformis. Loài này được ghi nhận
ở cả 4 vùng canh tác cà rốt. Cả bốn quần thể này đều có các đặc điểm hình thái
và số đo tương đồng với nhau và tương đồng với quần thể được mô tả bởi
Dasgupta et al. (1968) và N.N. Châu & N.V. Thanh (2000).
3.2.5. Giống Hemicriconemoides Chitwood & Birchfield, 1957
Giống Hemicriconemoides ghi nhận loài H. strictathecatus ở Hải Dương và
Hưng Yên. Quần thể ở Hưng Yên có kích thước cơ thể nhỏ hơn quần thể ở Hải
Dương. Hai quần thể này đều có các đặc điểm hình thái và số đo tương đồng
với các quần thể đã được mô tả trước đó bởi Esser 1960 và Geraert 2010. Hiện
nay, loài H. strictathecatus được gộp chung từ ba loài trước đây là loài
H. strictathecatus, H. litchi và H. mangiferae.
Đặc trưng phân tử
Trình tự vùng gen D2D3 của quần thể H4359 tương đồng từ 95 - 99% với
các quần thể thuộc loài H. strictathecatus. Quần thể H4359 biến đổi nucleotide
từ 1 - 2% so với các quần thể thuộc loài H. strictathecatus (từ KM516173 -
KM516178) và biến đổi nucleotide là 5% so với các quần thể thuộc loài
H. litchi (AY780956, KF856540, MH142618 và KP192481). Tuy nhiên, 2 loài
này đã được nhập chung thành một loài là loài H. strictathecatus. Quần thể
H4359 tạo thành cùng 1 nhánh lớn đối với H. strictathecatus với giá trị
bootstrap là 96.
11
Hình 3.10. Cây phát sinh chủng loại dạng ML (mô hình TN93+G) dựa trên
vùng gen D2D3 của các loài Hemicriconemoides spp.
3.2.6. Giống Mesocriconema Andrássy, 1965
Giống Mesocriconema ghi nhận loài M. sphaerocephalum ở Hà Nội và Hải
Dương. Hai quần thể này có đặc điểm hình thái tương đồng với quần thể được
mô tả bởi Geraert (2010). Tuy nhiên, lại có nhiều sai khác so với quần thể
được mô tả ở Việt Nam như: chiều dài cơ thể, các giá trị a, c, vị trí của vulval
và chiều dài kim hút biến thiên rộng hơn; giá trị b, số vòng cơ thể, số vòng từ
đầu đến lỗ bài tiết nhỏ hơn (N.N. Châu và N.V. Thanh, 2000).
Đặc trưng phân tử
Trình tự vùng gen D2D3 của quần thể M4694 phân lập ở Hải Dương tương
đồng với loài M. sphaerocephalum (AB933464) 99%. Quần thể M4694 biển
KM516178 H. strictathecatus
KM516177 H. strictathecatus
KM516176 H. strictathecatus
KM516174 H