Đậu tương (Glycine max (L.) Merrill) là một trong những cây trồng
quan trọng hàng đầu ở nhiều quốc gia trên thế giới, trong đó có Việt Nam. Việc
tiêu thụ đậu tương và các sản phẩm từ đậu tương đang gia tăng trên toàn thế giới
do những tác dụng có lợi tới sức khỏe của con người, như phòng chống ung thư,
ngăn ngừa bệnh tiểu đường và béo phì, hạ cholesterol và bảo vệ rối loạn thận.
Hạt đậu tương là nguồn cung cấp dồi dào protein (32%-52%), lipid (12%-25%),
vitamin (B1, B2, C, D, E.), nhiều amino acid thiết yếu (lysine, tryptophan,
methionine, cysteine và leucine), chất xơ, năng lượng và các chất chuyển hóa
thứ cấp. Vì vậy, hạt đậu tương được sử dụng làm thực phẩm cho con người,
thức ăn cho gia súc, là nguồn nguyên liệu cho công nghiệp chế biến, mặt hàng
xuất khẩu có giá trị kinh tế cao. Không chỉ có giá trị kinh tế và dinh dưỡng cao,
cây đậu tương còn giữ vai trò quan trọng trong việc cải thiện độ phì và sử dụng
bền vững tài nguyên đất canh tác. Gần đây, một trong những ứng dụng được
quan tâm nhiều nhất của cây đậu tương là sản xuất dầu diesel sinh học.
129 trang |
Chia sẻ: thientruc20 | Lượt xem: 380 | Lượt tải: 0
Bạn đang xem trước 20 trang tài liệu Luận án Nghiên cứu đặc điểm và chuyển gen GmDREB2 nhằm cải thiện tính chịu hạn của cây đậu tương (Glycine max (L.) Merrill), để xem tài liệu hoàn chỉnh bạn click vào nút DOWNLOAD ở trên
1
MỞ ĐẦU
1. Đặt vấn đề
Đậu tương (Glycine max (L.) Merrill) là một trong những cây trồng
quan trọng hàng đầu ở nhiều quốc gia trên thế giới, trong đó có Việt Nam. Việc
tiêu thụ đậu tương và các sản phẩm từ đậu tương đang gia tăng trên toàn thế giới
do những tác dụng có lợi tới sức khỏe của con người, như phòng chống ung thư,
ngăn ngừa bệnh tiểu đường và béo phì, hạ cholesterol và bảo vệ rối loạn thận.
Hạt đậu tương là nguồn cung cấp dồi dào protein (32%-52%), lipid (12%-25%),
vitamin (B1, B2, C, D, E...), nhiều amino acid thiết yếu (lysine, tryptophan,
methionine, cysteine và leucine), chất xơ, năng lượng và các chất chuyển hóa
thứ cấp. Vì vậy, hạt đậu tương được sử dụng làm thực phẩm cho con người,
thức ăn cho gia súc, là nguồn nguyên liệu cho công nghiệp chế biến, mặt hàng
xuất khẩu có giá trị kinh tế cao. Không chỉ có giá trị kinh tế và dinh dưỡng cao,
cây đậu tương còn giữ vai trò quan trọng trong việc cải thiện độ phì và sử dụng
bền vững tài nguyên đất canh tác. Gần đây, một trong những ứng dụng được
quan tâm nhiều nhất của cây đậu tương là sản xuất dầu diesel sinh học.
Đậu tương được xem là cây trồng nhạy cảm với hạn. Hạn là yếu tố phi
sinh học gây ảnh hưởng nghiêm trọng nhất và có thể làm giảm năng suất cây
đậu tương khoảng 40%. Hạn ảnh hưởng đến tất cả các thời kì sinh trưởng và
phát triển của cây đậu tương, trong đó thời kì ra hoa và thời kì sau ra hoa đã
được chứng minh là những thời kì bị ảnh hưởng nghiêm trọng nhất. Hiện nay, do
những biến đổi về khí hậu, đặc biệt là hạn kéo dài, lượng mưa không đều ở các
thời điểm trong năm và giữa các vùng miền gây khó khăn cho sản xuất nông
nghiệp ở nhiều quốc gia, tại Việt Nam cũng không tránh khỏi những tác động
tiêu cực đó. Hơn nữa, Việt Nam có khoảng 75% diện tích là đồi núi, đất dốc,
khả năng giữ nước kém nên việc canh tác các cây trồng nói chung và cây đậu tương
2
nói riêng gặp rất nhiều khó khăn. Do đó, việc chọn tạo giống đậu tương có khả
năng chịu hạn tốt là vấn đề cấp thiết, mang tính thời sự ở Việt Nam cũng như
trên thế giới.
Tính chịu hạn của cây đậu tương do nhiều gen quy định, sản phẩm của các
gen này liên quan trực tiếp đến sự biểu hiện khả năng chịu hạn hoặc có chức
năng điều hoà nhóm gen chịu hạn. Một số gen của đậu tương đã được mô tả là
có phản ứng với tác động của hạn ở mức phiên mã. Trình tự cis và nhân tố trans
giữ vai trò quan trọng trong sự biểu hiện gen đáp ứng tác động của hạn. Các
protein DREB - Những nhân tố có tác động trans liên kết với các trình tự cis để
kích hoạt sự biểu hiện của các gen mục tiêu khi có tín hiệu stress ở thực vật.
Việc cải thiện đặc tính di truyền của cây đậu tương để thích nghi với hạn
được các nhà khoa học tiếp cận theo nhiều hướng: Lai hữu tính, gây đột biến
thực nghiệm, chọn lọc quần thể, công nghệ tế bào, công nghệ gen. Trong đó,
công nghệ gen được xem là biện pháp đem lại hiệu quả cao. Gần đây, đã có
những tiến bộ trong việc cải thiện tính chịu hạn của cây đậu tương thông qua các
kỹ thuật tác động vào nhân tố phiên mã hoặc yếu tố tín hiệu ở cây trồng chuyển
gen. Tuy nhiên ở nước ta, một số nghiên cứu mới chỉ dừng lại ở việc chuyển các
gen chức năng liên quan trực tiếp đến tính chịu hạn vào cây đậu tương, ít thấy
công bố kết quả hoàn chỉnh về chuyển gen mã hóa protein là nhân tố kích hoạt
quá trình phiên mã, trong đó có gen GmDREB2. Do đó, việc nghiên cứu đặc tính
phân tử, xác định chức năng gen mã hóa nhân tố phiên mã liên quan tới tính chịu
hạn, cũng như việc chuyển các gen này từ các giống đậu tương có khả năng chịu
hạn tốt sang giống có khả năng chịu hạn kém đang trở thành hướng nghiên cứu
triển vọng, nhận được sự quan tâm đặc biệt của các nhà khoa học ở trong và
ngoài nước.
Xuất phát từ những lý do trên, chúng tôi đã tiến hành đề tài luận án:
"Nghiên cứu đặc điểm và chuyển gen GmDREB2 nhằm cải thiện tính chịu
hạn của cây đậu tương (Glycine max (L.) Merrill)".
3
2. Mục tiêu nghiên cứu
2.1. Phân tích được đặc điểm của gen GmDREB2 phân lập từ các giống đậu
tương Việt Nam có khả năng chịu hạn khác nhau.
2.2. Biểu hiện được protein tái tổ hợp và chức năng sinh học của gen chuyển
GmDREB2 trên cây thuốc lá chuyển gen.
2.3. Tạo cây đậu tương chuyển gen và biểu hiện được protein tái tổ hợp
GmDREB2 trên cây đậu tương chuyển gen.
3. Nội dung nghiên cứu
3.1. Nghiên cứu thông tin, tách dòng và xác định trình tự gen GmDREB2 phân lập
từ cây đậu tương. Phân tích tính đa dạng trong trình tự nucleotide và protein của
gen GmDREB2 ở cây đậu tương.
3.2. Nghiên cứu thiết kế vector chuyển gen thực vật chứa cấu trúc mang gen
GmDREB2.
3.3. Nghiên cứu chuyển gen và phân tích biểu hiện gen GmDREB2 trên cây
thuốc lá: (i) Tạo cây thuốc lá chuyển gen mang cấu trúc gen GmDREB2. (ii)
Phân tích sự biểu hiện của protein tái tổ hợp GmDREB2 trong cây thuốc lá. (iii)
Đánh giá khả năng chịu hạn của các cây thuốc lá chuyển gen.
3.4. Nghiên cứu chuyển cấu trúc mang gen GmDREB2 vào cây đậu tương và
phân tích cây đậu tương chuyển gen.
4. Những đóng góp mới của luận án
Luận án là công trình đầu tiên ở Việt Nam nghiên cứu có hệ thống, từ việc
phân lập, tách dòng phân tử gen GmDREB2 đến thiết kế vector chuyển gen, tạo
cây chuyển gen và phân tích sự biểu hiện gen chuyển GmDREB2, cụ thể là:
(1) Gen GmDREB2 phân lập từ cây đậu tương có kích thước 480 nucleotide,
mã hóa cho 159 amino acid. Các trình tự gen GmDREB2 đã được đăng ký trên
4
Ngân hàng Gen mang các mã số: LK936507, LK936508, LK936509, HG965097,
HG965098, HG965099.
(2) Protein tái tổ hợp GmDREB2 biểu hiện mạnh trên cây thuốc lá chuyển gen.
Khi bị hạn, ở các dòng thuốc lá chuyển gen có hàm lượng prolin tăng từ
211,17% - 332,44% sau 5 ngày bị stress hạn và tăng từ 262,79% - 466,04% sau
9 ngày bị stress hạn.
(3) Tạo được cây đậu tương chuyển gen mang gen GmDREB2 và biểu hiện
thành công protein tái tổ hợp GmDREB2 trên giống đậu tương DT84.
5. Ý nghĩa khoa học và thực tiễn của đề tài luận án
5.1. Về mặt khoa học
Kết quả nghiên cứu góp phần làm sáng tỏ đặc điểm cấu trúc của gen
GmDREB2 phân lập từ 6 giống đậu tương Việt Nam (DT2008, CB, CBD, ĐT26,
ĐT51, ĐVN5). Những cơ sở khoa học của việc sử dụng kỹ thuật chuyển gen
nhằm cải thiện đặc tính chịu hạn của cây trồng đã được khẳng định thông qua
việc tăng cường protein tái tổ hợp GmDREB2 và biểu hiện chức năng sinh học
của gen chuyển GmDREB2 trên cây thuốc lá và cây đậu tương. Những kết quả
bước đầu về tạo cây chuyển gen đã mở ra hướng nghiên cứu ứng dụng kỹ thuật
chuyển gen trong mục đích nâng cao khả năng chịu hạn của cây đậu tương ở
Việt Nam.
Các bài báo công bố trên các tạp chí Khoa học - Công nghệ quốc tế và ở
trong nước, cùng với 6 trình tự gen công bố trên Ngân hàng Gen là những tư liệu
tham khảo có giá trị trong việc nghiên cứu, giảng dạy sinh học và công nghệ
sinh học.
5.2. Về mặt thực tiễn
Các trình tự gen GmDREB2 phân lập được, cấu trúc vector chuyển gen
thực vật mang gen GmDREB2, các cây thuốc lá chuyển gen tạo được có khả năng
5
chịu hạn tốt hơn so với cây đối chứng, các cây đậu tương chuyển gen đã góp phần
giải quyết những vấn đề cụ thể về việc ứng dụng kỹ thuật chuyển gen trong cải
thiện khả năng chịu hạn ở cây đậu tương nói riêng và các cây trồng khác nói
chung, mở ra triển vọng ứng dụng công nghệ mới trong thực tiễn chọn giống
cây trồng chịu hạn ở Việt Nam.
6
Chương 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU
1.1. CƠ CHẾ PHÂN TỬ CỦA ĐẶC TÍNH CHỊU HẠN Ở THỰC VẬT
1.1.1. Cơ chế chịu hạn của thực vật
Stress phi sinh học là nguyên nhân chính dẫn đến mất mùa trên toàn
thế giới, gây thiệt hại đến năng suất bình quân hơn 50% ở các loại cây trồng
chính [18]. Trong số các stress phi sinh học, hạn là yếu tố chính làm giảm năng
suất cây trồng. Stress hạn phá vỡ sự cân bằng nội môi và phân bố ion trong tế
bào [197]. Cây trồng phản ứng với các stress hạn thông qua các con đường
truyền tin và phản ứng tế bào như sản xuất protein stress, tăng cường các chất
chống oxi hóa, tích lũy các chất tan [36]. Các nghiên cứu gần đây cho thấy, hạn
gây ra những tác động tiêu cực tới tất cả các cấp độ và các giai đoạn phát triển
của thực vật. Để chống chịu với các stress hạn, thực vật phải thực hiện thông qua
chuỗi các quá trình, với sự tham gia của rất nhiều yếu tố. Khi có hạn, các phản
ứng sinh hóa khác nhau được kích hoạt trong cây trồng để tích lũy nhiều loại
chất dễ hòa tan, như đường, amino acid, glycine betaine và polyamine để giúp
các cây trồng đối phó với hạn [71], tăng lượng chất chống oxy hóa khác nhau,
chẳng hạn như glutathione S-transferase (GST), superoxide dismutase (SOD),
guaiacol peroxidase (POD) và catalase (CAT) chống lại điều kiện oxy hóa để
phục hồi sau một thời gian nhất định bị hạn [12].
Gần đây, những tiến bộ trong việc hiểu biết về biểu hiện gen, cơ chế
phiên mã và việc truyền tín hiệu phản ứng với stress hạn của cây trồng đã được
công bố [198]. Mặt khác, phân tích sinh học phân tử và di truyền học đã tạo điều
kiện thuận lợi cho những khám phá về chức năng gen [155], [170] và được ứng
dụng trong kỹ thuật di truyền với việc sử dụng một số gen chức năng hoặc một
số gen điều hòa để kích hoạt các cơ chế liên quan đến tính chịu hạn, chịu mặn
của cây trồng [176]. Vì vậy, cơ sở phân tử đặc tính chịu hạn của thực vật nói
chung và cây đậu tương nói riêng cũng dần được sáng tỏ. Các gen phản ứng với
7
stress hạn có thể chia thành 2 nhóm chính: Nhóm gen chức năng mà sản phẩm
của chúng tham gia trực tiếp vào các phản ứng stress hạn như gen điều hòa áp
suất thẩm thấu [167], gen mã hóa các protein chống oxi hóa [100], gen mã hóa
protein LEA (Late embryogenesis abundant) [181], gen mã hóa protein vận
chuyển LTP (Lipid trasfer protein) [111], aquaporin [48]; nhóm gen điều khiển
cho ra các sản phẩm bao gồm các nhân tố phiên mã và các protein kinase truyền
tin. Các nhân tố phiên mã liên quan đến khả năng chịu hạn đang được quan tâm
nghiên cứu bao gồm DREB [24], WRKY [193], [195], bZIP (Basic leucine
zipper) [54], MYB (Myeloblastosis oncogene) [90], [103], NCED (Nine-cis-
epoxycarotenoid dioxygenase) [137] và AP2/ERF [193]. Các protein kinase
truyền tin bao gồm: Protein kinase phụ thuộc Ca2+ [80], MAPK (Mitogen activated
protein kinase) [112], RPK (Receptor-like protein kinase) [29], PIK (Phophatidyl
inositol kinase) [185] và protein kinase serine/threonine [102] (Hình 1.1).
Hình 1.1. Cơ chế chịu hạn của thực vật
8
Sự biểu hiện của các gen cảm ứng với hạn liên quan chặt chẽ với quá
trình phiên mã. Vì vậy, sự biểu hiện của các gen này chịu ảnh hưởng rất nhiều
của môi trường trong và ngoài cơ thể, với nhiều mức độ điều hòa.
Các nhân tố phiên mã (Transcription factors - TFs) đóng vai trò điều
khiển quan trọng của những thay đổi trong biểu hiện gen và phản ứng với các
stress môi trường. Có thể thấy rõ ở cây trồng, các gen mã hóa nhân tố phiên mã
chiếm một phần lớn trong hệ gen. Ví dụ, ở cây Arabidopsis có đến 1500 TF
trong hệ gen [140]. Cả hai loại: Nhân tố kích hoạt và ức chế quá trình phiên mã
đã được sử dụng để nâng cao khả năng chịu hạn cho cây trồng, hầu hết các gen
này đã được xác định và phân tích ở cây Arabidopsis [19]. Hiện nay, các protein
DREB (một trong bốn phân họ lớn của họ AP2/ERF) là nhóm TF được nghiên
cứu thành công nhất trong điều kiện phi sinh học, bởi vì nó kích hoạt sự biểu
hiện của nhiều gen mục tiêu chịu trách nhiệm kiểm soát các yếu tố liên quan
[71]. Wang và cs (2009) đã xác định được trong cây Arabidopsis có 474 gen
mục tiêu mà các nhân tố phiên mã DREB tác động [183]. Trong số những gen này,
có 160 gen có đáp ứng với stress phi sinh học và 27 gen cảm ứng với tình trạng
thiếu nước [106].
1.1.2. Họ nhân tố phiên mã AP2
Các nhân tố phiên mã có thể được phân chia thành nhiều loại khác nhau
dựa trên cấu trúc vùng liên kết của chúng với sợi DNA. Các nhân tố phiên mã như
nhân tố có tác động trans và trình tự cis giữ vai trò trung tâm hoạt hóa promoter
trong biểu hiện của các gen mục tiêu. Kết quả những phân tích về hoạt hóa
promoter phản ứng với điều kiện bất lợi, trình tự cis và nhân tố có tác động trans
liên quan đến phản ứng của các gen với điều kiện bất lợi đã được xác định [178].
Họ AP2/ERF là một nhóm lớn các nhân tố phiên mã ở thực vật, bao gồm
bốn phân họ lớn: AP2 (APETALA 2), RAV (RelatedtoABI3/VP1), ERF
(Ethylene-responsive element binding factor) và DREB (Dehydration responsive
element binding ) [148].
9
1.1.2.1. Cây phát sinh của họ nhân tố phiên mã AP2/ERF
Họ AP2/ERF là một nhóm lớn các nhân tố phiên mã có chứa miền
AP2/ERF. Ở cây Arabidopsis chứa 145 locus gen mã hóa các nhân tố phiên mã
của họ AP2/ERF [148] và ở lúa có 167 locus [152]. Miền AP2/ERF lần đầu tiên
được tìm thấy ở Arabidopsis homeotic APETALA 2 [74]. Tương tự, miền này
cũng tìm thấy ở cây thuốc lá (Nicotiana tabacum), đó là yếu tố phản ứng với
ethylene (EREBPs) [124]. Miền AP2/ERF có khoảng 60 amino acid có liên quan
chặt chẽ với nhau [184]. Protein thuộc họ AP2/ERF là những nhân tố phiên mã
có ở thực vật và người ta cũng tìm thấy ở cả những thực vật bậc thấp như tảo
xanh (Chlamydomonas reinhardtii) [157], tương đồng với các miền AP2/ERF ở
vi khuẩn. Do đó, có giả thuyết cho rằng các miền AP2/ERF được chuyển từ một
loài vi khuẩn Cyanobacterium cộng sinh hoặc từ một loại vi khuẩn hay virus bởi
hiện tượng biến nạp gen [98]. Ở đầu N và ở đầu C của miền AP2/ERF có chứa
một đoạn xoắn β tương tự như kiểu xoắn α có chức năng nhận biết điểm bám
trên promoter [158].
Phân tích mối quan hệ và thiết lập cây phát sinh họ AP2/ERF từ bốn
phân họ: Arabidopsis, Selaginella moellendorffii, Physcomitrella patens và
Chlamydomonas reinhardtii, mà đại diện tương ứng là thực vật hạt kín, thông đất,
rêu và tảo xanh (Hình 1.2). Mỗi nhánh trong cây phát sinh đại diện cho một nhóm
và các thành viên của họ AP2/ERF có thể được chia thành ba nhóm dựa trên cấu
trúc tổng thể [141].
Phân họ AP2/ERF trong nhóm Arabidopsis gồm 14 thành viên chứa hai
miền AP2/ERF, phân họ RAV gồm 6 thành viên có chứa một miền AP2/ERF và
thêm một miền B3, trong khi các phân họ khác gồm 125 thành viên chỉ có một
miền AP2/ERF [152]. Phân họ AP2/ERF ở thực vật có hạt có thể được chia
thành các phân nhóm AP2 và nhóm ANT [13].
Sakuma và cs (2002) đã phân tích mối quan hệ của 125 thành viên chứa
duy nhất miền AP2/ERF dựa trên cơ sở miền AP2/ERF của nhóm Arabidopsis.
10
Thông qua phân tích này, 125 thành viên có một miền AP2/ERF được chia thành
ba nhóm: Nhóm A gồm 56 thành viên thuộc phân họ DREB, nhóm B gồm 65
thành viên thuộc phân họ ERF và nhóm còn lại gồm 4 thành viên thuộc những
phân họ khác. Phân họ DREB được chia thành 6 phân nhóm, từ A-1 đến A-6,
phân họ ERF cũng được chia thành 6 phân nhóm, từ B-1 đến B-6. Các
DREB1/CBF thuộc phân nhóm A-1 và các DREB2 thuộc phân nhóm A-2 [148].
Nakano và cs (2006) phân tích mối quan hệ của các thành viên chứa duy nhất
miền AP2/ERF trong Arabidopsis và lúa, kết quả thu được tương tự như phân
loại của Sakuma và cs (2002). Tuy nhiên, ông cho biết thêm phân nhóm A-1 và
A-4 cùng nguồn gốc và phân nhóm A-2 và A-3 cùng nguồn gốc [115].
Hình 1.2. Cây phát sinh của họ nhân tố phiên mã AP2/ERF ở thực vật có
diệp lục [109].
11
Họ nhân tố phiên mã AP2/ERF chỉ có ở thực vật và điều này đặt ra câu
hỏi: Chúng đã tiến hóa như thế nào trong lịch sử phát triển của thực vật? Trong
sơ đồ cây phát sinh loài ở hình 1.2, P. patens và chi nhánh S. moellendorffii được
tìm thấy trong tất cả bốn phân họ lớn và trong một nhánh của AT4G13040
orthologues. Hơn nữa, P. Patens và S. moellendorffii được tìm thấy trong tất cả
các phân nhóm, trừ A-1 và B-2. Điều đó chứng tỏ, rêu và thực vật có mạch
chung nguồn gốc. Phân nhóm A-1 (DREB1s) có quan hệ gần gũi với phân nhóm
A-4 và cùng chung nguồn gốc với phân nhóm A-5. Trong thực tế, người ta
không tìm thấy phân nhóm A-1 ở cây hạt trần. Trong cây phát sinh loài ở hình 1.2,
C. reinhardtii tìm thấy ở bốn nhánh, hai nhánh trong phân họ ERF và hai nhánh
trong phân họ AP2. Điều đó chứng tỏ, trước khi xuất hiện thực vật ở cạn, nhân tố
phiên mã AP2/ERF đã chứa một miền AP2/ERF hoặc chứa hai miền AP2/ERF.
Ngược lại, người ta chưa tìm thấy phân họ RAV ở C. reinhardtii [109].
1.1.2.2. Nhân tố phiên mã DREB
Từ những năm 80 của thế kỷ XX, các nhà khoa học trên thế giới đã quan tâm
nghiên cứu về DREBs, tiến hành giải trình tự gen DREBs trên các loài họ cúc
(Asteraceae), hướng dương (Helianthus annuus), lúa mì (Triticum aestivum L.)
và so sánh trình tự gen này của các loài cây trồng và hoang dại cho thấy có sự
sai khác giữa chúng [5]. Từ đó, họ đã đề xuất phương án cải thiện khả năng
chống chịu thông qua việc cải tiến ở mức phân tử của cơ chế này với điều kiện
bất lợi trong môi trường sống, đó là chuyển gen mục tiêu từ loài chống chịu tốt
vào loài chống chịu kém. Những gen này bao gồm cả các gen chức năng, như
gen mã hóa những chất chuyển hóa khác nhau quan trọng đối với khả năng chịu
hạn, hoặc gen mã hóa các nhân tố phiên mã. Đối với cây đậu tương, hướng
nghiên cứu này bước đầu đã đạt được những thành công nhất định [6].
Nhiều thành viên phân họ DREB nhạy cảm với điều kiện bất lợi đã được
phân lập, mô tả và các nghiên cứu đã khẳng định chúng là những thành tố quan
trọng, liên quan đến sự phản ứng với nhân tố phi sinh học ở thực vật bằng cách
12
quy định biểu hiện gen thông qua các trình tự DRE/CRT [188]. Khi phân tích
các gen mã hóa nhân tố phiên mã DREB, các nhà khoa học đã xác định được 36
gen DREB/CBF trong cây nho (Vitis Vinifera) [200], 57 gen trong cây
Arabidopsis, 52 gen trong cây lúa (Oryza sativa L.) [115], 77 gen trong cây
Populos trichocarpa thuộc họ liễu [199], 36 gen trong cây đậu tương [192].
Một số thành viên của phân họ gen DREB được xác định có trong hệ gen
của cây đậu tương như: GmDREBa, GmDREBb, GmDREBc, GmDREB1,
GmDREB2, GmDREB3, GmDREB5, GmDREB6, GmDREB7 [141]. Mỗi gen
trong phân họ DREB có trình tự, độ dài khác nhau nhưng đều được biểu hiện
mạnh khi đậu tương gặp các điều kiện về hạn. Nhóm DREB1 điều khiển tính
chịu hạn, mặn và lạnh, trong khi nhóm DREB2 có vai trò chủ yếu trong điều
khiển tính chịu hạn, chịu nóng. Chen và cs (2004) đã phân lập gen DREB1 từ
mRNA của cây đậu tương có kích thước 705 bp [27]. Charlson và cs (2009) đã
phân lập được gen DREB1 từ DNA của cây đậu tương cũng có kích thước 705
bp [23]. Chen và cs (2007) đã phân lập gen GmDREB5 từ mRNA ở cây đậu
tương với kích thước là 927 bp [25]. Chen và cs (2009) đã phân lập gen
GmDREB3 từ mRNA ở cây đậu tương với kích thước là 597 bp [26]. Liu và cs
(2007) đã phân lập gen GmDREB6 từ mRNA ở cây đậu tương với kích thước là
693 bp [96]... Ở Việt Nam, vấn đề nghiên cứu về các gen DREB ở cây trồng nói
chung và cây đậu tương nói riêng vẫn còn rất mới mẻ, chỉ có một vài công trình
công bố về các gen DREB trong những năm gần đây, đó là các nghiên cứu về
đặc điểm cấu trúc và chức năng của gen DREB1 và DREB5 ở cây đậu tương
của Chu Hoàng Mậu và cs (2011) [5].
1.1.2.3. Phân nhóm DREB2
Phân nhóm DREB2 gồm có 8 thành viên ở trong cây Arabidopsis [148]
và 5 thành viên trong cây lúa [107]. Phân tích sự phát sinh của các protein
DREB2 từ cây Arabidopsis và cây lúa, cũng như các protein liên quan cho thấy,
phân nhóm DREB2 liên quan chặt chẽ với phân nhóm A-3, trong đó có ABI4
13
(ABA-Insensitive 4). Phân nhóm DREB2 trong cây Arabidopsis và lúa có thể
đều được chia thành ba phân nhóm phụ [107]. Ngoài ra, phân nhóm DREB2
cũng đã được phân lập từ một số loài thực vật hạt kín khác như hướng dương
[41], lúa [42], [107], lúa mì [43], [153], lúa mạch (Hordeum vulgare) [187], ngô
(Zea mays L) [134]. Hầu hết các gen DREB2 đã được công bố đều cảm ứng với
sự mất nước hoặc nhiệt độ cao, nhưng các gen DREB2 từ thực vật thân cỏ còn
cảm ứng với lạnh [43], [107], [153]. Điều đáng chú ý là tất cả các DREB2 được
phân lập có cảm ứng stress thuộc phân nhóm phụ 1, t